新疆石河子部分地区猪流行性腹泻病毒遗传变异分析

作     者：黄新 吴桐忠 韩猛立 张星星 何延华 钟发刚 HUANG Xin;WU Tong-zhong;HAN Meng-li;ZHANG Xing-xing;HE Yan-hua;ZHONG Fa-gang

作者机构：新疆农垦科学院/省部共建新疆绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室 

出 版 物：《中国兽医杂志》 (Chinese Journal of Veterinary Medicine)

年 卷 期：2019年第55卷第5期

页      面：17-20页

学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：新疆农垦科学院科技引导计划(63YYD201311) 

主　　题：猪流行性腹泻病毒 遗传进化 S基因 ORF3基因 新疆石河子 

摘      要：为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)遗传变异情况,从石河子的3个地区已确诊PED猪场采集病料,分别获得了3株PEDV S基因序列和ORF3基因序列,将其进行序列比对及遗传进化分析。根据3株S基因序列分析表明,XJ-SHZ148、XJSHZ146株与韩国QIAP1401株(KX793713)序列相似性最高,达到97.4%和98.7%;XJ-SW株与广东GD-03 2012株(KP870115)序列相似性最高,达到98.5%。3个分离株与PEDV疫苗株AF353511(CV777)性序列相似性分别为94.5%、94.2%和94.1%。系统进化分析表明,XJ-SHZ148、XJ-SHZ146与韩国的KPV1406(KM108353))、QIAP1401(KX793713))同为一群。XJ-SW株与广东GD/03/2012((KP870115))、GD/2011株(KP870115)同为一群;3株PEDV ORF3基因序列与疫苗株(CV777)序列比对多个位点存在突变,序列相似性较低。