龙须菜5．8S rRNA和ITS区的克隆与系统学分析

作     者：李敏 隋正红 易恒 张学成 阎炳伦 朱明 LI Min;SUI Zheng-Hong;YI Heng;ZHANG Xue-Cheng;YAN Bing-Lun;Zhu Ming

作者机构：中国海洋大学海洋生命学院山东青岛266003 淮海工学院海洋学院江苏连云港222005 

出 版 物：《中国海洋大学学报（自然科学版）》 (Periodical of Ocean University of China)

年 卷 期：2009年第39卷第1期

页      面：77-83页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：国家高技术研究发展规划项目课题(2006AA10A413) 山东省教学改革研究课题(B05009) 江苏省海洋生物技术重点建设实验室开放课题(2007HS005)资助 

主　　题：龙须菜 江蓠科 5.8S rRNA-ITS 系统发育 

摘      要：研究青岛产龙须菜居群内的遗传多样性和系统学分类,通过对龙须菜居群内不同个体的5.8S rRNA-ITS区(包括ITS1-5.8S rRNA-ITS2)进行PCR扩增和序列分析,得到扩增DNA片段长度均为1 066 bp,包含完整的ITS1(250 bp)、5.8S(159 bp)和ITS2(657 bp);利用GenBank数据库对Gracilaria(江蓠属)和Gracilariopsis属共20个物种的rRNA-ITS相应序列进行了比较和系统进化分析。结果表明,龙须菜和江蓠科19个物种中rRNA的5.8S区的长度和序列非常保守,而ITS区的长度和序列则变异较大,20种江蓠科物种的遗传距离在0.013～0.596之间,龙须菜在5.8S rRNA-ITS区特性上相比江蓠属物种与Gracilariopsis属物种更为相似;采用UPGMA法构建了这20种江蓠科物种的系统发育树;分析结果表明青岛产龙须菜的居群内不存在遗传差异,且应属于Gracilariopsis属,并且在江蓠科中较早分化,而龙须菜处于Gracilariopsis属中比较古老的位置。