申克孢子丝菌PalI和PalI样蛋白生物信息学分析

作     者：詹蔚 刘鹏 吴晓雁 李玉哲 黄怀球 ZHAN Wei;LIU Peng;WU Xiao-Yan;LI Yu-Zhe;HUANG Huai-Qiu

作者机构：中山大学附属第三医院急诊科广东广州510630 中山大学附属第三医院岭南医院检验科广东广州510080 中山大学附属第三医院皮肤科广东广州510630 

出 版 物：《菌物学报》 (Mycosystema)

年 卷 期：2019年第38卷第8期

页      面：1350-1358页

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：中山大学重点发展项目(基于天河二号的真菌疾病精准诊疗平台建设和技术研究)~~ 

主　　题：申克孢子丝菌 生物信息学分析 PalI蛋白 PalI样蛋白 

摘      要：为初步了解申克孢子丝菌Sporothrix schenckii基因组中真菌特有蛋白PalI和PalI样蛋白的生物学特征,利用在线生物信息学分析软件,对两蛋白理化特征、功能域、二级结构、抗原表位等进行分析预测。发现两蛋白理论分子量分别为24.6kDa和75.6kDa,等电点均偏碱性;属于同一蛋白家族,具有相同的功能域和多个PKC磷酸化位点;两蛋白在近氨基端区域相似度较高,并与其他模式真菌中同源蛋白有很高相似度;同时,两蛋白都有跨膜区,氨基端序列三级结构极为相似,并有丰富的抗原表位。通过生物信息学分析对申克孢子丝菌PalI和PalI样蛋白生物学特征有了初步的认识,为后续实验研究提供有力支持。