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基于trnH-psbA和matK序列的油茶种子DNA条形码鉴定

DNA Barcoding Identification of Camellia spp. Seed Based on trnH-psbA and matK Sequences

作     者:戚华沙 代佳妮 杨英楠 李思颖 王健 石林春 吴友根 赖杭桂 胡新文 于靖 Qi Huasha;Dai Jiani;Yang Yingnan;Li Siying;Wang Jian;Shi Linchun;Wu Yougen;Lai Hanggui;Hu Xinwen;Yu Jing

作者机构:海南大学热带农林学院海口570228 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193 

出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期:2019年第17卷第15期

页      面:5057-5065页

学科分类:0907[农学-林学] 08[工学] 0829[工学-林业工程] 09[农学] 

基  金:2017年海南省重大科技计划项目(ZDKJ2017004) 海南省自然科学基金面上项目(201608364) 2016年海南大学地方服务项目(SHFW201604) 2016年海南省重点研发专项(ZDYF2016157) 2016年海南省中药现代化项目(J7S1213100001)共同资助 

主  题:越南油茶(Camellia vietnamensis) 普通油茶(Camellia oleifera) DNA条形码 trnH-psbA序列 matK序列 

摘      要:本研究利用叶绿体基因组trnH-psbA和matK序列对不同物种的34份油茶种子进行DNA条形码鉴定,以分析这两个序列在鉴别越南油茶(Camellia vietnamensis)和普通油茶(Camellia oleifera)的效率。结果表明:34份供试材料的trnH-psbA序列全长395 bp、11个变异位点,系统发育树将普通油茶聚为一支,支持率为72%;matK序列全长837 bp、2个变异位点,系统发育树将越南油茶与高州油茶聚为一支,支持率为64%。可见,trnH-psbA序列和mat K序列结合,可对普通油茶和越南油茶与其他供试油茶物种进行有效鉴别。

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