水分子间氢键判别标准的从头分子动力学模拟研究
A study on criteria for hydrogen bonds between water molecules using ab initio molecular dynamics simulation作者机构：唐山学院基础部河北唐山063000 河北工业大学理学院天津300401
出 版 物：《河北工业大学学报》 (Journal of Hebei University of Technology)
年 卷 期：2014年第43卷第4期
页 面：84-88页
学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术]
基 金：国家自然科学基金(90403007 10975044) 唐山市科技局项目(131302111b) 唐山学院自然科学项目(13005B)
摘 要：在统计水体系的氢键特征时,应用氢键的能量判别标准与几何判别标准存在着明显的差别.为了研究这一问题,应用从头分子动力学软件CPMD对水二聚体在不同构象下的相互作用能量进行了系统计算.计算结果表明当两个水分子的氢原子间距离H…H2.0或受体氧原子与供体氢原子间距离O…H1.62时,水分子间的相互作用能由于排斥作用而显著增加.此时,虽然一些水分子对满足氢键的几何判据但两者间的相互作用能已经超出了氢键结合能判据的标准.因此本文建议在传统的氢键几何判别标准的基础上增加水分子间氢原子距离判据H…H,以及受体氧原子与供体氢原子间距离判据O…H.这样可以有效的减少几何判别方法在统计水体系的氢键时产生的统计偏差,同时也可以使氢键的几何标准与结合能标准尽可能相一致.
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