基于梨贝壳杉烯氧化酶基因PpKO序列的功能性SNP标记
Development of Functional SNP Markers Anchored PpKO Gene in Pear作者机构:青岛农业大学园林园艺学院山东青岛266109
出 版 物:《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)
年 卷 期:2012年第39卷第10期
页 面:1876-1884页
核心收录:
学科分类:09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学]
基 金:山东省自然科学基金项目(Y2008D51) 山东省良种工程项目 山东省科技发展计划项目(2011GNC11018)
摘 要:基于基因序列的功能性标记是基因分型、图谱定位和相关性状标记辅助选择的理想标记。以 矮生梨 × 茌梨 的梨杂交分离群体和9个梨栽培品种为试材,以梨赤霉素合成代谢途径的关键酶基因--贝壳杉烯氧化酶基因(PpKO)的cDNA序列为基础,设计5对PCR引物,通过高通量熔解曲线(high resolution melting,HRM)分析,筛选到可对基因进行良好分型的1对引物。通过对杂种后代和测试品种的测序分析表明,此对引物的扩增子是一个位于PpKO第8外显子上的长度为200bp的序列,从中共检测到两处单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)变化,且均为非同义cSNP。这两处SNP标记均可以作为适合高通量分析的遗传标记在遗传作图、基因定位或资源鉴定中加以利用。