新疆顿巴斯他乌盐湖沉积物免培养古菌多样性

作     者：朱莉 杨红梅 王芸 廖先燕 邓丽娟 李珊 娄恺 艾尔肯.热合曼 Li Zhu;Hongmei Yang;Yun Wang;Xianyan Liao;Lijuan Deng;Shan Li;Kai Lou;Erkin Rahman

作者机构：新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046 新疆农业科学院微生物应用研究所乌鲁木齐830091 

出 版 物：《微生物学报》 (Acta Microbiologica Sinica)

年 卷 期：2012年第52卷第6期

页      面：769-775页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学] 

基　　金：新疆维吾尔自治区自然科学基金(2011211B41) 新疆特殊环境微生物实验室开放课题(XJYS0203-2010-05)~~ 

主　　题：高盐环境 盐湖 海盐环境(thalassohaline) 古菌多样性 16S rDNA同源性 

摘      要：【目的】了解新疆顿巴斯他乌盐湖沉积物免培养古菌组成及多样性。【方法】利用免培养法直接从顿巴斯他乌盐湖沉积物样品中提取环境总DNA,采用古菌通用引物对16S rRNA基因进行扩增,构建基因克隆文库。对随机挑选的59个阳性克隆进行HaeⅢ限制性酶切分型并测序、BLAST比对及构建16S rRNA基因系统发育树。【结果】文库覆盖率为89%,Shannon-Wiener指数为2.69,共得到21个不同的可操作分类单元,分属于广古菌门(Euryarchaeota,92%)和泉古菌门(Crenarchaeota,8%),其中多数为盐杆菌科(Halobacteriaceae,88%)的盐杆菌属(Halobacterium,24%)、盐盒菌属(Haloarcula,18%)、盐碱红菌属(Natronorubrum,14%)、盐红菌属(Halorubrum,8%)等,与海盐环境(thalassohaline)获得的16S rRNA基因序列相似性最高(﹥95%);整个文库中约11%的克隆与可培养古菌多个属的相似性小于97%。【结论】顿巴斯他乌盐湖古菌多样性略低于同类高盐环境,组成较为一致,只是各类群所占百分比稍有不同,且可能存在一些潜在新物种或新类群。