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新疆两典型微咸水湖水体免培养古菌多样性

生态学报 2012年第21期32卷 6811-6818页

作者：邓丽娟娄恺曾军徐赢华史应武张煜星新疆特殊环境微生物实验室乌鲁木齐830091 石河子大学生命科学学院石河子832003

微咸水湖是湖泊演化过程中的一个重要中间状态,以新疆两典型微咸水湖-赛里木湖和柴窝堡湖水为研究对象,采用微孔滤膜收集菌体,SDS-酚-氯仿抽提法直接提取湖水总DNA,利用古菌16S rRNA基因通用引物进行PCR扩增,分别构建两湖古菌16S rRNA... 详细信息

微咸水湖是湖泊演化过程中的一个重要中间状态,以新疆两典型微咸水湖-赛里木湖和柴窝堡湖水为研究对象,采用微孔滤膜收集菌体,SDS-酚-氯仿抽提法直接提取湖水总DNA,利用古菌16S rRNA基因通用引物进行PCR扩增,分别构建两湖古菌16S rRNA基因克隆文库。用限制性内切酶HaeⅢ对随机挑选的阳性克隆子进行酶切分型,分别得到7个和8个可操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs),两文库覆盖率均大于98%。BLAST比对和系统发育分析表明赛里木湖全部克隆子归属于泉古菌门(Crenarchaeota),97%的克隆子与不同环境免培养氨氧化泉古菌有较高的序列相似性(>97%)。柴窝堡湖水古菌归为3个门:Thaumarchaeota(81.2%)、广古菌门(Euryarchaeota)(13%)和泉古菌门(Crenarchaeota)(5.8%),81.2%的克隆子与具有氮代谢功能的氨氧化古菌纯培养物具有较高的序列相似性(97%—98%),13%的克隆子与已分离到的产甲烷古菌序列同源性大于97%。研究发现新疆微咸水湖可能存有大量新划分的古菌Thaumarchaeota门类群、可培养氨氧化及产甲烷古菌类群,两典型微咸水湖泊中古菌类群多样性较低且群落组成差异大。

关键词：微咸水湖古菌 16S rRNA基因

一种基于BIOLOG代谢指纹分析的油气微生物勘探新方法

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微生物学报 2012年第4期52卷 505-511页

作者：廖先燕张涛曾军孙建胡雯娄恺新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046 新疆农业科学院微生物应用研究所乌鲁木齐830091

【目的】建立基于土壤微生物群落生理功能代谢的油气微生物勘探新方法。【方法】采集新疆玛北油气藏区浅层地表土壤样品45份,非油气藏区样品25份,利用BIOLOG微平板,测定微生物群落代谢活性,采用判别分析模型判断油气藏区微生物异常。【... 详细信息

【目的】建立基于土壤微生物群落生理功能代谢的油气微生物勘探新方法。【方法】采集新疆玛北油气藏区浅层地表土壤样品45份,非油气藏区样品25份,利用BIOLOG微平板,测定微生物群落代谢活性,采用判别分析模型判断油气藏区微生物异常。【结果】从95种碳源中,筛选到10种能够体现油气藏区与非油气藏区土壤微生物群落结构差异的典型碳源,利用判别函数对试验及对照区进行回判,油气藏区判别正确率为97.8%,非油藏区判别正确率为100%,总判别正确率为98.6%。【结论】BIOLOG技术能高效准确的用于油气藏初步勘测。

关键词：土壤微生物群落油气勘探 BIOLOG技术

新疆富蕴地震断裂带植被恢复对土壤古菌群落的影响

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生态学报 2013年第2期33卷 454-463页

作者：林青曾军张涛马晶王重娄恺新疆农业科学院微生物应用研究所乌鲁木齐830091 新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046

选取新疆富蕴地震断裂带8种次生植物根际土壤,以同土层裸地为对照,测量土壤化学性质,利用末端限制性片段长度多态性技术研究塌陷区次生植物对土壤古菌群落的影响。结果表明,多数植物根际土壤养分显著(P<0.05)高于对照,其主要古菌类群为... 详细信息

选取新疆富蕴地震断裂带8种次生植物根际土壤,以同土层裸地为对照,测量土壤化学性质,利用末端限制性片段长度多态性技术研究塌陷区次生植物对土壤古菌群落的影响。结果表明,多数植物根际土壤养分显著(P新疆地震断裂带植被的恢复可影响根际土壤古菌群落的分布、组成和结构,其原因与植物根际土壤化学性质有关,同时在改善土壤肥力方面也有显著效果。

关键词：地震断裂带根际微生物末端限制性片段长度多态性

新疆地震断裂带次生植物根际土壤微生物碳源利用

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应用生态学报 2011年第9期22卷 2297-2302页

作者：林青曾军马晶王重张涛李珊娄恺新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046 新疆农业科学院微生物应用研究所乌鲁木齐830091

利用BIOLOG技术研究了新疆富蕴地震断裂带6种次生植物对根际土壤微生物碳源利用的影响.结果表明:多数植物根际土壤养分显著高于对照.6种根际土壤的平均颜色变化率差异显著,且均高于对照.次生植物不影响根际土壤微生物碳源利用的丰富度,... 详细信息

利用BIOLOG技术研究了新疆富蕴地震断裂带6种次生植物对根际土壤微生物碳源利用的影响.结果表明:多数植物根际土壤养分显著高于对照.6种根际土壤的平均颜色变化率差异显著,且均高于对照.次生植物不影响根际土壤微生物碳源利用的丰富度,但改变了其优势度和均匀度.不同处理根际土壤微生物碳源利用存在差异,主要体现在对糖类、氨基酸类、羧酸类的利用上.断裂带上次生植物的出现使土壤微生物利用碳源的类型由酚类向糖类、羧酸类转变.土壤速效钾含量与土壤微生物对聚合物(r=-0.84)、胺类(r=-0.83)的利用呈负相关.新疆地震断裂带的次生植物能显著增强土壤微生物的碳源利用能力,改变碳源利用类型.密刺蔷薇和蓍在提高土壤微生物碳源利用能力和改善土壤养分方面效果最佳.

关键词：地震断裂带根际微生物功能多样性 BIOLOG PCA

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金针菇生物活性物质结构与功能的研究进展

中草药 2007年第10期38卷 1596-1596,I0001,I0002页

作者：金湘娄恺毛培宏新疆大学离子束生物技术中心新疆乌鲁木齐830008 新疆特殊环境微生物重点实验室新疆乌鲁木齐830000

金针菇Flammulina velutipes含有多种生物活性物质,具有很高的药用价值。总结了近年来金针菇中火菇素(flammulin)、溶细胞素(flammutoxin)、免疫调节蛋白(Fip-fve)、抗病毒蛋白、跨上皮电抗性蛋白(TEER-TDP)和金针菇多糖(FVP)的研究进展。

关键词：金针菇火菇素溶细胞素免疫调节蛋白Fip—fve

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日偏食对乌鲁木齐空气可培养细菌群落的影响

生态学报 2011年第16期31卷 4671-4679页

作者：马晶孙建张涛曾军林青邓丽娟娄恺新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046 新疆特殊环境微生物实验室乌鲁木齐830091

利用自然沉降法采集2009年7月19日至24日日偏食前后乌鲁木齐空气微生物,以可培养法分析日偏食对其细菌群落组成的影响。结果如下:(1)细菌数量和种类均随日偏食临近而增多,当天达到峰值,随后减少。(2)所获81株细菌经测序及系统发育分析... 详细信息

利用自然沉降法采集2009年7月19日至24日日偏食前后乌鲁木齐空气微生物,以可培养法分析日偏食对其细菌群落组成的影响。结果如下:(1)细菌数量和种类均随日偏食临近而增多,当天达到峰值,随后减少。(2)所获81株细菌经测序及系统发育分析将其归为4个门,分别为放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),其中放线菌门为优势类群,占细菌总数的54%。(3)不同采样时间细菌群落组成的聚类分析显示,日偏食发生前1d(21日)和当天(22日)空气细菌组成较为相似聚为一类,其余日期的聚为一类。(4)典型相关分析(Canonical CorrelationAnalysis,CCA)发现,放线菌门中菌株与绝大多数大气环境因子呈正相关性;变形菌门和厚壁菌门与大多数大气环境因子呈正相关性;而拟杆菌门中的菌株只与温度、风速和太阳风速度呈正相关。结果表明,日偏食会增加乌鲁木齐空气可培养细菌的数量和种类。

关键词：日偏食空气微生物可培养法

新疆特殊生境岩石内生细菌末端限制性片段长度多态性技术分析

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微生物学报 2012年第3期52卷 381-388页

作者：牟文婷张涛孙建曾军徐赢华吴尊凤胡雯娄恺新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046 新疆农业科学院微生物应用研究所乌鲁木齐830091

【目的】了解新疆特殊生境不同类型岩石内生细菌的组成及多样性。【方法】采用末端限制性片段长度多态性技术(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism,T-RFLP),分析新疆乌苏花岗岩(1号样)、一号冰川和木垒变质岩(2,3号样)... 详细信息

【目的】了解新疆特殊生境不同类型岩石内生细菌的组成及多样性。【方法】采用末端限制性片段长度多态性技术(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism,T-RFLP),分析新疆乌苏花岗岩(1号样)、一号冰川和木垒变质岩(2,3号样)、裕民和托克逊岩石漆(4,5号样)内生细菌群落。【结果】样品间多样性指数变化不大;聚类分析表明岩石类型相同,其相似性较高,2号样和3号样聚为一支并与1号样再聚为一支,4号样与5号样聚为一支;各样品共有种群为厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),1号样存在酸杆菌门(Acidobacteria),2号样存在浮霉菌门(Planctomycetes);除5号样优势类群为放线菌门(29.3%),其它4个样品均为变形菌门,只是所占比例略有不同。【结论】生境不同的同类型岩石的内生细菌群落组成存在差异,各类岩石中可能存在大量未知细菌新种。

关键词：岩石内生细菌 T-RFLP 多样性

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醉马草免培养内生细菌的多样性

生态学报 2011年第8期31卷 2178-2187页

作者：张雪兵史应武曾军娄恺新疆农业科学院微生物应用研究所乌鲁木齐830091 新疆农业大学食品学院乌鲁木齐830052

为了解醉马草内生细菌的组成和多样性,采用液氮研磨法提取醉马草总DNA,利用内生细菌16S rRNA基因特异性引物对醉马草总DNA进行16S rRNA基因扩增,构建醉马草内生细菌16S rRNA基因文库。对筛选到249个克隆进行HaeШ酶切分析,得到57个操作... 详细信息

为了解醉马草内生细菌的组成和多样性,采用液氮研磨法提取醉马草总DNA,利用内生细菌16S rRNA基因特异性引物对醉马草总DNA进行16S rRNA基因扩增,构建醉马草内生细菌16S rRNA基因文库。对筛选到249个克隆进行HaeШ酶切分析,得到57个操作分类单元(OTUs)。系统发育分析将其归为4个门:变形杆菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)以及1个未知类群。其中74%的克隆与可培养细菌中的37个属具有高的16SrRNA基因序列相似性(97%—100%),其中芽孢杆菌属(Bacillus spp.)、红球菌属(Rhodococcus spp.)、黄杆菌属(Flavobacterium spp.)、黄单胞杆菌属(Xanthomonas spp.)最为丰富。另外26%的克隆序列与GenBank中已存细菌16S rRNA基因序列相似性小于96%。研究结果表明,醉马草中可培养内生细菌丰富,多样并且可能存在一些潜在新物种或新类群。

关键词：醉马草内生细菌免培养法生物多样性

新疆断裂带泉水中细菌群落结构的PCR-DGGE分析

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生态学报 2011年第2期31卷 506-512页

作者：吴江超高小其曾军徐建华杨晓芳娄恺新疆农业科学院微生物应用研究所乌鲁木齐830091 新疆石河子职业技术学院石河子832000 新疆维吾尔自治区地震局乌鲁木齐830011 新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046

乌鲁木齐10号泉起源于天山山脉博格达峰,地下径流于地震断裂带,泉水中硫化氢、甲烷等地球化学元素迁移活跃,为揭示水文地球化学变化对地震断裂带泉水细菌群落结构的影响,本研究对该泉水样品定期采样,以微孔滤膜收集菌体,使用SDS-酶解法... 详细信息

乌鲁木齐10号泉起源于天山山脉博格达峰,地下径流于地震断裂带,泉水中硫化氢、甲烷等地球化学元素迁移活跃,为揭示水文地球化学变化对地震断裂带泉水细菌群落结构的影响,本研究对该泉水样品定期采样,以微孔滤膜收集菌体,使用SDS-酶解法提取总DNA,对细菌16S rDNA V3区进行PCR-DGGE分析并对条带测序,条带的光密度信息与监测的地球化学指标进行典型相关分析(CCA)。结果表明B16(Uncultured bacterium)和ε-变性菌纲(epsilon proteobacterium)与氟含量成正相关;黄杆菌B1(Flavobacterium)、绿脓假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)、B10(Uncultured bacterium)和腐生性葡萄球菌(Staphylococcus saprophyticus)与硫化物呈正相关;硫微螺菌(Thiomicrospira arctica)、黄杆菌B3(Flavobacterium)及阿尔莱葡萄球菌(Staphylococ-cus arlettae)与氢气呈正相关。断裂带泉水细菌能够对地层深处渗透出的地球化学元素产生灵敏的应答。

关键词：地球化学细菌群落 PCR-DGGE 泉水