31株深圳地区婴幼儿感染百日咳鲍特菌的流行特点、基因型、亲缘关系与大环内酯耐药性

作     者：姜含芳 刘孝荣 陈虹宇 朱纯青 邢志浩 马东礼 Jiang Hanfang;Liu Xiaorong;Chen Hongyu;Zhu Chunqing;Xing Zhihao;Ma Dongli

作者机构：深圳市儿童医院深圳病原体高通量基因测序技术工程实验室518038 

出 版 物：《中华微生物学和免疫学杂志》 (Chinese Journal of Microbiology and Immunology)

年 卷 期：2019年第39卷第4期

页      面：270-276页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 1010[医学-医学技术（可授医学、理学学位）] 100202[医学-儿科学] 10[医学] 

基　　金：深圳市科创委基础研究项目(JCYJ20160429181145972,JCYJ20170413094034978) 深圳市卫计委临床研究课题(SZLY2017016) 

主　　题：百日咳鲍特菌 二代测序 基因型 大环内酯耐药性 

摘      要：目的通过分析百日咳感染患儿的临床信息和鉴定百日咳鲍特菌的基因型、耐药性和亲缘性,了解深圳地区百日咳鲍特菌的流行特点、基因组变异与大环内酯类耐药情况。方法百日咳患儿的临床信息采集自深圳市儿童医院电子病历系统。我们对分离自患儿咽拭子的31株百日咳鲍特菌进行二代测序和基因组从头组装。通过序列比对鉴定多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、毒力基因型与23S rRNA突变位点。通过构建系统进化树分析亲缘性。通过E-test鉴定临床分离株对大环内酯类抗生素的耐药性。结果31株百日咳鲍特菌的MLST分型均为ST-2。毒力基因型呈多样性,其中2株为prn缺失型。基于进化树,深圳株与疫苗株亲缘关系远。19株百日咳鲍特菌为红霉素耐药,均携带23S rRNA编码基因的A2047G突变。结论深圳地区百日咳鲍特菌的毒力基因型呈多样性,非疫苗株的基因型逐渐增多。大环内酯耐药株已有传播。本研究为改进百日咳的防治和疫苗策略提供了参考。