人乳头瘤病毒16型L1蛋白B细胞表位预测

作     者：王爱萍 蒋敏 栗宁 张改平 祁艳华 刘燕凯 席宇 周景明 

作者机构：郑州大学生命科学学院河南郑州450001 

出 版 物：《细胞与分子免疫学杂志》 (Chinese Journal of Cellular and Molecular Immunology)

年 卷 期：2016年第32卷第4期

页      面：442-445页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：河南省教育厅科技创新人才支持计划项目(14HASTIT027) 河南省科技攻关计划重点项目(102102310076) 

主　　题：人乳头瘤病毒 L1蛋白 宫颈癌 B细胞表位 生物信息学 

摘      要：目的预测人乳头瘤病毒16型L1（HPV-16 L1）蛋白的B细胞表位。方法先从NCBI的蛋白质数据库中获得HPV-16 L1蛋白的氨基酸序列,再采用DNAStar中的Protean模块分析HPV-16型L1蛋白的二级结构、柔韧性、亲水性、表面可及性以及抗原性,然后结合吴玉章等建立的氨基酸抗原性指数方法计算其平均抗原指数（AI）,综合分析上述多个参数,预测其可能的B细胞表位区域,并用在线BLAST进行同源性匹配分析。结果综合分析多个参数,预测得出HPV-16 L1蛋白的B细胞表位可能位于第51～58、87～97、214～220、290～296、335～341、351～366、408～418、430～442和475～496肽段,进一步的同源性匹配分析显示肽段51～58、335～341、351～366、408～418、430～442以及475～496为其B细胞表位优势区域,其中肽段51（PIKKPNNN）58、351（SETTYKNTNFKEYLRH）366、408（PPPGGTLEDTY）418和430（KHTPPAPKEDPLK）442的氨基酸序列为HPV-16型L1蛋白所特有,而肽段475（KAKPKFTLGKRKATPTTSSTST）496与HPV-16 E1蛋白具有同源性、335（DTTRSTN）341的氨基酸序列与很多其他型别的HPV的L1蛋白具有同源性。结论综合多种方案预测得到HPV-16 L1的多个B细胞表位优势区域。