表皮生长因子受体和抑制剂之间分子对接的研究

作     者：朱丽荔 侯廷军 陈丽蓉 徐筱杰 

作者机构：北京大学化学与分子工程学院北京100871 

出 版 物：《化学学报》 (Acta Chimica Sinica)

年 卷 期：2002年第60卷第1期

页      面：43-48页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 07[理学] 0703[理学-化学] 

基　　金：国家自然科学基金(Nos.29873003 29992590-2)资助项目 

主　　题：表皮生长因子受体 4-苯胺喹唑啉类抑制剂 分子动力学 分子力学 分子对接 相互作用模式 抗癌药物 药物设计 

摘      要：研究了表皮生长因子受体（EGFR）和4-苯胺喹啉类抑制剂之间的相互作用模式.表皮生长因子受体的三维结构通过同源蛋白模建的方法得到,而抑制剂和靶酶结合复合物结构则通过分子力学和分子动力学结合的方法计算得到.从模拟结果得到的抑制剂和靶酶之间的相互作用模式表明范德华相互作用、疏水相互作用以及氢键相互作用对抑制剂的活性都有重要的影响.抑制剂的苯胺部分位于活性口袋的底部,能够与受体残基的非极性侧链产生很强的范德华和疏水相互作用.抑制剂双环上的取代基团也能和活性口袋外部的部分残基形成一定的范德华和疏水性相互作用.而抑制剂喹唑啉环上的氮原子能和周围的残基形成较强的氢键相互作用,对抑制剂的活性有较大的影响.计算得到抑制剂和靶酶之间的非键相互作用能以及抑制剂和靶酶之间的相互作用信息能够很好地解释抑制剂活性和结构的关系,为全新抑制剂的设计提供了重要的结构信息.