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蛋白质中较频繁发生的β发夹结构(β—Hairpins)模式──蛋白质超二级结构(MOTIF)研究(Ⅲ)

THE PATIERN OF FREQUENT OCCURRENCE β-HAIRPIN STRUCTURE IN PROTEINS ──THE RESEARCH OF SUPERSECONDARY MOTIFS IN PROTEINS (Ⅲ)

作     者:孙之荣 

作者机构:清华大学生物科学与技术系 

出 版 物:《生物物理学报》 (Acta Biophysica Sinica)

年 卷 期:1994年第10卷第4期

页      面:665-670页

学科分类:071011[理学-生物物理学] 0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 

主  题:连裂短肽 α螺旋 β折叠 β发夹结构 蛋白 

摘      要:分析了240个分辨率在2.5A以上的高精度蛋白结构,研究了α螺旋和β折叠的连接短肽中的β发夹结构模式。首先对较频繁发生的超二级结构组中的E—loop—E[1](即β回折结构-βTurn)进行了分析,对每一种β回折结构的氢键长度进行了计算,然后将其模型化。在对β发夹模型化的分析中,同时考虑了连接短肽的长度和氢键模式两个因素。找出了在240个蛋白样本库中较常发生的β发夹结构的模式。该结果对结构比较模型、X衍射晶体结构的解析,以及β发夹结构的预测有一定意义。

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