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三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)雌雄性腺的差异转录组分析

COMPARATIVE TRANSCRIPTOME ANALYSIS OF FEMALE AND MALE GONADS OF PORTUNUS TRITUBERCULATUS

作     者:汤玉洁 棘怀飞 王欢 李晔 TANG Yu-Jie;JI Huai-Fei;WANG Huan;LI Ye

作者机构:宁波大学海洋学院宁波315211 

出 版 物:《海洋与湖沼》 (Oceanologia Et Limnologia Sinica)

年 卷 期:2019年第50卷第1期

页      面:197-203页

核心收录:

学科分类:0908[农学-水产] 09[农学] 

基  金:国家自然科学基金/青年科学基金项目 31402282号 浙江省重大科技专项 2012C12907-9号 

主  题:三疣梭子蟹 转录组 雌雄性腺 荧光定量PCR 基因表达 

摘      要:三疣梭子蟹(Portunustrituberculatus)是我国东海海域具有重要经济价值的蟹类。为探讨雌雄梭子蟹性腺基因表达差异,挖掘与性腺发育相关基因,利用高通量测序技术对三疣梭子蟹雌雄性腺进行测序和生物信息学分析,为进一步研究其性腺发育及性别分化机制提供基础。测序结果经denovo组装共获得192848个转录本,130054个unigene。差异表达分析发现,其中101742个unigene上调,37588个unigene下调。在差异表达数据库中筛选出EcR、RXR、VTG等6个可能参与三疣梭子蟹的性腺分化发育的基因,并利用荧光定量PCR验证其在雌雄性腺中的表达情况,验证结果与转录组测序结果基本一致,为深入研究三疣梭子蟹性腺分化发育调控分子机理和相关功能基因提供了重要的基因数据资源。

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