异源蛋白质相互作用数据整合算法的进展
Advances in algorithms applied on various protein-protein interaction data sources integration作者机构：上海大学生命科学学院上海200444 中国科学院上海生命科学信息中心上海200031
出 版 物：《生命科学》 (Chinese Bulletin of Life Sciences)
年 卷 期：2008年第20卷第5期
页 面：821-826页
学科分类：0710[理学-生物学] 0831[工学-生物医学工程（可授工学、理学、医学学位）] 0711[理学-系统科学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术]
基 金：“973”项目(2007CB108800) “863”项目(2006AA02Z313) 国家自然科学基金(90408010)
摘 要：蛋白质相互作用在生物学过程和细胞功能行使中起核心作用。高通量技术的应用结合计算机预测方法的发展,使得直接和间接来源的蛋白质相互作用数据得到了大规模的增加。如何系统地整合这些数据并从中提取有用的信息是一项挑战,这也促使了许多整合算法应运而生。本文综述了八种整合蛋白质相互作用数据源的方法:投票、支持向量机、朴素贝叶斯、逻辑斯蒂回归、决策树、随机森林、基于随机森林的k-近邻法以及混合属性分类等方法。
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