广东番茄曲叶病毒G3分离物基因组DNA-A的分子特征
The molecular characteristics of DNA-A of tomato leaf curl Guangdong virus isolate G3作者机构:广东省农业科学院植物保护研究所
出 版 物:《植物病理学报》 (Acta Phytopathologica Sinica)
年 卷 期:2005年第35卷第3期
页 面:208-213页
核心收录:
学科分类:09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学]
基 金:广东省自然科学基金(031992) 广东省重点实验室二期建设启动项目(2003B60128)
主 题:广东番茄曲叶病毒G3 DNA—A 序列分析 分子特征
摘 要:从采集于广东花都的番茄曲叶病病株上分离到病毒分离物ToLCGDV-[G3],序列分析结果表明,其DNA-A为单链环状,全长2744 nt,共有6个ORFs,其中病毒链上编码AV1(CP)、AV2,互补链上编码AC1、AC2、AC3和***结果显示,与ToLCGDV-[G3]基因组有同源关系的均属双生病毒科菜豆金色花叶病毒属.进一步比较结果表明,ToLCGDV-[G3]与有同源性的菜豆金色花叶病毒属病毒的DNA-A全序列同源率最高为87.9%.其中IR的同源率为59.0%~85.3%,而AW、AV2、AC1、AC2、AC3和AC4这6个ORFs同源率分别为73.6%~95.2%、64.0%~95.4%、71.7%~87.7%、69.6%~93.9%、67.7%~95.1%和64.1%~94.2%,它们各自编码的氨基酸序列同源率分别为76.3%~99.2%、52.6%~95.7%、69.7%~88.1%、51.9%~88.9%、63.4%~92.5%和33.0%~90.7%.系统进化关系分析结果显示,ToLCGDV-[G3]与ToLCGDV-[G2]亲缘关系最近,二者组成一个独立的分支,与其它40种菜豆金色花叶病毒属病毒的亲缘关系均较远.因此,ToLCGDV-[G3]可能是一个先前未报道的双生病毒科菜豆金色花叶病毒属新种.