魔芋GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因及其启动子的克隆与分析

作     者：李鹏佳 焦茂娟 王启军 苏承刚 LI Peng-jia;JIAO Mao-juan;WANG Qi-jun;SU Cheng-gang

作者机构：西南大学园艺园林学院/南方山地园艺学教育部重点实验室重庆400715 

出 版 物：《西南大学学报（自然科学版）》 (Journal of Southwest University(Natural Science Edition))

年 卷 期：2019年第41卷第3期

页      面：14-22页

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：国家级大学生创新创业训练计划项目(201710635018) 国家自然科学基金项目(31071796) 

主　　题：魔芋 GDP-甘露糖焦磷酸化酶 启动子克隆与功能分析 

摘      要：以花魔芋和白魔芋为材料,通过魔芋5个转录组高通量测序数据库,与拟南芥进行tBlastn比对、拼接,得到魔芋中的GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因GMP的推定全长,设计基因特异性引物,克隆得到魔芋GMP基因的部分cDNA序列,长度为1 233 bp,其中基因编码区长度为1 086 bp,编码的氨基酸为361个.在此基础上运用FNPI-PCR技术得到了魔芋GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因GMP上游启动子2 116 bp,经生物信息学分析,该序列具有典型的TATA-box、 CAAT-box及与胁迫相关的元件和光应答元件.