民猪低温胁迫的基因表达谱分析

作     者：杨月莹 刘娣 丁常宏 祁雪莲 YANG Yue-ying;LIU Di;DING Chang-hong;QI Xue-lian

作者机构：东北农业大学理学院黑龙江哈尔滨150030 黑龙江省农业科学院黑龙江哈尔滨150086 黑龙江中医药大学黑龙江哈尔滨150040 

出 版 物：《江西农业大学学报》 (Acta Agriculturae Universitatis Jiangxiensis)

年 卷 期：2013年第35卷第4期

页      面：807-812页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：黑龙江省自然科学青年基金(QC2012C034) 黑龙江省博士后基金(LBH-Z10039) 

主　　题：基因表达谱 目标优化 低温胁迫 特征选择 

摘      要：随着基因芯片在基因的发现与识别等研究方面的应用,高通量并行识别特征基因成为表达谱分析的重要工作之一。地方猪种民猪在抗寒性方面表现出较好的生物特征,提出的目标优化方法在识别民猪抗寒性状相关基因方面效果较好。通过制备常温状态和低温状态两类样本的基因芯片,获得了民猪低温胁迫的表达谱数据,通过目标优化算法多次迭代筛选得到的特征基因集合,对于不同的特征基因集合的分析,最终确定民猪抗寒性状相关基因,注释在生物学数据库中获得了相应的基因功能。目标优化算法泛化性能较好,能够同步进行特征基因的选择和样本分类两过程。