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BC_1设计下标记密度对QTL定位精确性的影响

Effect of marker density on QTL mapping in a backcross design

作     者:王鲜萍 鲁绍雄 Wang Xianping;Lu Shaoxiong

作者机构:河南大学生命科学学院河南开封475001 云南农业大学动物科技学院云南昆明650201 

出 版 物:《河南科技学院学报(自然科学版)》 (Journal of Henan Institute of Science and Technology(Natural Science Edition))

年 卷 期:2012年第40卷第1期

页      面:32-36页

学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0836[工学-生物工程] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基  金:河南大学重点科研项目"影响畜禽QTL定位精确性的主要因素研究" 

主  题:BC1设计 标记密度 QTL定位 最大似然法 

摘      要:通过计算机模拟分析BC1设计中标记密度(标记间隔分别为5、10、20、50 cM)对数量性状基因座(QTL)定位精确性的影响,以均方误(MSE)为衡量指标.结果表明:当遗传图谱上相邻标记间的图距在5 cM以上时,提高标记密度,对于提高QTL定位的准确性和精确性具有积极的效应,但当标记密度达到某一程度(相邻标记间图距为2 cM)时,由于方法本身的局限,继续增加标记密度,对标记-QTL连锁分析法定位QTL的效果则没有实际意义,标记密度对检验统计量LOD值的影响不明显.

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