基因芯片筛选结肠癌伊立替康耐药相关基因
Analysis of Gene Expression Patterns in an Irinotecan-resistance Colon Cancer Cell by cDNA Microarray作者机构:四川大学华西医院肿瘤中心腹部肿瘤科成都610041
出 版 物:《四川大学学报(医学版)》 (Journal of Sichuan University(Medical Sciences))
年 卷 期:2011年第42卷第1期
页 面:15-18,36页
核心收录:
学科分类:1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学]
基 金:国家自然科学基金(批准号30901719 30971519)资助
摘 要:目的应用基因芯片技术进行结肠癌伊立替康耐药相关基因表达谱差异分析,探讨伊立替康结肠癌耐药发生机制。方法分别抽提人结肠癌细胞系SW480及其伊立替康耐药细胞系SW480/CPT总RNA,逆转录合成相应以Cy3标记的cRNA做探针,在Agilent基因芯片上杂交,Axon4000B扫描仪扫描芯片荧光信号图像,Genepix3.0图像软件对扫描图像进行数字化处理和分析。利用RT-PCR对筛选出的部分差异表达基因进行验证。结果筛选出差异表达基因1598个,其中基因表达上调911个,基因表达下调687个。谷胱甘肽S转移酶同工酶(GSTA)家族GSTA1、GSTA2、GSTA3、GSTA5明显上调,锌指蛋白(ZNF)家族多个成员也有显著差异表达。结论基因芯片结果提示,GSTA与ZNF基因可能在介导伊立替康耐药过程中起着重要的调控作用。