甲型流感病毒PB1-PA蛋白作用位点的发现与分析

作     者：何淼 林强乾 赵艳超 张淑波 陈维田 HE Miao;LIN Qiangqian;ZHAO Yanchao;ZHANG Shubo;CHEN Wei Tian

作者机构：中山大学生命科学学院广东广州510275 香港理工大学屋宇设备工程系 

出 版 物：《中山大学学报（自然科学版）》 (Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni)

年 卷 期：2011年第50卷第2期

页      面：81-86页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金重点资助项目(60736028) 广东省科技计划项目重大专项资助项目(2003A3080503) 

主　　题：共进化理论 甲型流感病毒 PB1蛋白 PA蛋白 相互作用位点 

摘      要：基于共进化理论,探究了甲型流感病毒PB1蛋白与PA蛋白上具有共同进化可能性的保守九聚片段(C9MP)。结构信息显示PB1蛋白的第1-15位氨基酸与PA蛋白的第239-716位氨基酸具有相互作用域;对该区域变异分布的分析发现,PA蛋白第670位氨基酸Q所在的C9MP与PB1蛋白的第9位氨基酸F、第12位氨基酸V和第13位氨基酸P所在的C9MP在PB1MP1相互作用面上具有最低的共进化值。结合DSSP程序的分析表明,由PA蛋白第670位氨基酸Q与PB1蛋白的第9位氨基酸F、第12位氨基酸V与第13位氨基酸P构成的区域可能成为潜在的相互作用位点。