细粒棘球绦虫AgB5抗原表位的生物信息学预测

作     者：刘学磊 刘玉梅 曹文艳 兰希 彭珊珊 王倩 丁剑冰 马秀敏 

作者机构：新疆医科大学第一附属医院、新疆重大疾病医学重点实验室一省部共建国家重点实验室培育基地新疆乌鲁木齐830011 新疆医科大学基础医学院 

出 版 物：《中国病原生物学杂志》 (Journal of Pathogen Biology)

年 卷 期：2015年第10卷第1期

页      面：38-41页

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(No.81260253,31160194,30960358,81160200,81060135) 新疆维吾尔自治区自然基金项目(No.2012211A304) 

主　　题：细粒棘球绦虫 抗原B 抗原表位 生物信息学 

摘      要：目的应用计算机在线预测软件分析细粒棘球绦虫AgB5抗原蛋白的二级结构,预测其可能形成的B细胞表位和T细胞表位,为研制安全、高效的新型包虫病基因疫苗奠定基础,也为包虫病的免疫学治疗提供新的理论依据。方法采用计算机在线预测软件SOPMA对细粒棘球绦虫AgB5抗原蛋白的二级结构进行预测和分析;采用LEPS和ABC Pred网络软件结合其表面特性、亲水性、柔韧性、可及性、可塑性等对其B细胞表位进行预测和分析;采用IEBD和SYFPEITHI在线软件对细粒棘球绦虫AgB5抗原蛋白的MHC-I类HLA-A 0201限制性T细胞表位进行预测和分析。结果采用计算机在线预测软件预测细粒棘球绦虫AgB5抗原蛋白的二级结构中α螺旋结构占76.47%,β-折叠占5.88%,无规则卷曲占17.65%。结合其表面特性、亲水性、柔韧性、可及性以及可塑性等分析得出分值较高的3个B细胞表位区域,分别为：6~14、28~33和48~52氨基酸序列,较易形成B细胞表位;通过MHC-I类HLA-A 0201限制性T细胞表位分析得出分值较高的4个T细胞表位区域,分别为：9~13、24~29、38~45和51~59氨基酸序列,较易形成T细胞表位。结论通过生物信息网络技术方法分析确定细粒棘球绦虫AgB5抗原蛋白分别存在3个B细胞抗原表位和4个T细胞抗原表位,可为细粒棘球绦虫AgB抗原性研究和高效表位疫苗研发提供参考,为临床包虫病的免疫诊断、药物治疗提供新的靶标。