陆地棉(Gossypium hirsutum)光敏色素B基因(GhPHYB)克隆及其生物信息学分析

作     者：李建平 郝晓燕 陈勋基 陈果 罗城 刘海峰 黄全生 Li Jianping;Hao Xiaoyan;Chen Xunji;Chenguo;Luo Cheng;Liu Haifeng;Huang Quansheng

作者机构：中国彩棉(集团)股份有限公司乌鲁木齐830023 新疆农业科学院核技术生物技术研究所乌鲁木齐830091 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2015年第13卷第8期

页      面：1725-1729页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：中国彩棉(集团)股份有限公司博士后科研工作站研究项目 自治区公益性科研院所基本科研业务经费项目(KY2015015)共同资助 

主　　题：陆地棉 光敏色素B 克隆 RNAi干涉 

摘      要：本研究依据已公布的雷蒙德氏棉基因组测序结果,采用同源克隆的方法,以陆地棉TM-1幼苗为材料,利用RT-PCR技术克隆得到陆地棉光敏色素B基因(Gh PHYB)的c DNA序列。结果显示:该基因ORF全长3 582 bp,编码1 194个氨基酸;通过与已知的拟南芥光敏色素B氨基酸序列比对及蛋白结构预测,发现该基因包含植物光敏色素完整的结构,与烟草、拟南芥、水稻、小麦和玉米的氨基酸序列相似性分别为87.2%、77.9%、74.5%、74.5%和54.6%。同时,本研究还构建了Gh PHYB基因的RNAi干涉载体用于转化棉花,并通过构建棉花PHYB RNAi突变体了解陆地棉PHYB基因对棉花株型、开花期、产量、棉纤维品质、抗逆性等方面的调控作用。研究结果可为该基因今后应用于棉花生产奠定基础。