儿童新诊断与慢性免疫性血小板减少症差异基因分析

作     者：马利敏 杨学文 杨海平 阮林海 MA Li-min;YANG Xue-wen;YANG Hai-ping;RUAN Lin-hai

作者机构：河南科技大学第一附属医院血液科洛阳471023 

出 版 物：《中国医药生物技术》 (Chinese Medicinal Biotechnology)

年 卷 期：2019年第14卷第1期

页      面：33-38页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100202[医学-儿科学] 10[医学] 

基　　金：洛阳市科技计划项目(1503007A-4) 

主　　题：血小板减少症 基因表达谱 儿童 计算生物学 差异表达基因 免疫应答 

摘      要：目的筛选儿童新诊断与慢性免疫性血小板减少症(ITP)之间的差异表达基因(DEGs)并进行生物信息学分析。方法从基因表达数据库中下载芯片表达谱GSE46922数据集,利用BRB-ArrayTools软件鉴定DEGs,然后分别对差异基因进行基因本体(GO)功能富集分析、Pathway富集分析和互作网络分析。结果共筛选出1225个DEGs,其中上调基因665个,下调基因560个。GO富集分析发现DEGs主要参与转录调控、小分子代谢、蛋白泛素化、凋亡调控、固有免疫反应、病毒复制等生物学过程。Pathway富集分析发现DEGs显著富集于代谢通路、内质网蛋白加工、破骨细胞分化、MAPK信号通路、病毒感染、凋亡等。网络分析鉴定出的核心基因有CHD4、UQCR10、AP2M1、SIRPγ和GPR180,核心Pathways包括MAPK信号通路、细胞周期和细胞凋亡。结论明确了儿童新诊断与慢性ITP的基因表达谱不同,为进一步阐明儿童ITP发生发展的分子机制和指导早期治疗干预提供了基础。