立枯丝核菌不同融合群菌株GPD基因的克隆及序列特征分析

作     者：王艳丽 任衍春 张震 王教瑜 毛雪琴 姜华 邱海萍 柴荣耀 杜新法 孙国昌 WANG Yan-li;REN Yan-chun;ZHANG Zhen;WANG Jiao-yu;MAO Xue-qin;JIANG Hua;QIU Hai-ping;CHAI Rong-yao;DU Xin-fa;SUN Guo-chang

作者机构：浙江省植物有害生物防控重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地/浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所杭州310021 

出 版 物：《中国水稻科学》 (Chinese Journal of Rice Science)

年 卷 期：2013年第27卷第6期

页      面：639-646页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(31071644) 农业部转基因专项(2011ZX08009-003-001) 浙江省公益性重大项目(2011C12901-1 2011C12901-2 2011C12022) 浙江省农科院国际合作项目(2009) 

主　　题：立枯丝核菌 GPD基因 克隆 进化分析 融合群 

摘      要：利用同源克隆的方法对11个立枯丝核菌标准融合群菌株的GPD基因进行了分离。分析发现不同融合群立枯丝核菌GPD基因在外显子数目、编码蛋白长度及内含子剪切方式等方面存在差异,如AG-2-2ⅢB、AG-2-2Ⅳ、AG-8三个融合群的GPD基因的外显子个数为10个,其他融合群均为11个;AG-8融合群的GPD基因的编码蛋白长度为267个氨基酸,其余融合群的GPD基因的编码蛋白长度约为340个氨基酸。AG-2-2ⅢB、AG-2-2Ⅳ、AG-8三个融合群的GPD基因在98、98、272氨基酸位点的内含子发生了缺失。基于蛋白序列的进化分析表明不同融合群之间GPD基因编码蛋白存在明显差异,可以有效地将不同融合群菌株区分开来;同时,不同物种之间GPD基因在进化上仍具有一定保守性,立枯丝核菌自身的GPD基因蛋白序列归为一类且与担子菌门同源性最高。这些结果表明进行保守基因序列差异分析是进行立枯丝核菌分类分群研究的新思路。