Development and application of functional gene arrays for microbial community analysis

作     者：Z. L. HE J. D. VAN NOSTRAND L.Y. WU J. Z. ZHOU 

作者机构：Institute for Environmental Genomics Department of Botany and Microbiology University of Oklahoma Norman OK 73019 USA 

出 版 物：《中国有色金属学会会刊：英文版》 (Transactions of Nonferrous Metals Society of China)

年 卷 期：2008年第18卷第6期

页      面：1319-1327页

核心收录：

学科分类：0806[工学-冶金工程] 08[工学] 0818[工学-地质资源与地质工程] 0815[工学-水利工程] 0805[工学-材料科学与工程（可授工学、理学学位）] 080502[工学-材料学] 0813[工学-建筑学] 0703[理学-化学] 0814[工学-土木工程] 0702[理学-物理学] 

基　　金：This study was supported by the Oklahoma Applied Research Support (OARS), Oklahoma Center for the Advancement of Science and Technology (OCAST), the State of Oklahoma through the Project AR062-034, and the United States Department of Energy under the Genomics: GTL program through the Virtual Institute of Microbial Stress and Survival (VIMSS http://vimss.lbl.gov), Environmental Remediation Science Program (ERSP), Office of Biological and Environmental Research, Office of Science 

主　　题：微数列 应用 函数基因标记 微生物种群 

摘      要：功能的基因标记能关于功能的基因差异和微生物引起的社区的潜在的活动提供重要信息。尽管 microarray 技术成功地被使用了为纯文化学习基因表示，简单、人工的微生物引起的社区，改编如此的一种技术分析复杂微生物引起的社区仍然以设计，样品准备，和数据分析提出很多挑战。这个工作集中于功能的基因数组(FGA ) 的开发和应用程序为微生物引起的社区研究指向关键功能的基因标记。一些与 FGA 有关明确地给问题调音，例如 oligonucleotide 探查设计， nucleic 酸抽取和纯化，数据分析，特性，敏感，和量的能力详细被讨论。最近的研究证明了 FGA 能从许多自然环境关于微生物引起的社区提供特定、敏感、潜在地量的信息并且控制生态系统。这种技术被期望革命化微生物引起的社区的分析，并且连接微生物引起的结构到生态系统工作。