香蕉MaARF19-1基因的克隆及序列分析

作     者：黄东梅 许奕 李敬阳 林妃 李艳霞 李羽佳 魏卿 宋顺 Huang Dongmei;Xu Yi;Li Jingyang;Lin Fei;Li Yanxia;Li Yujia;Wei Qing;Song Shun

作者机构：中国热带农业科学院海口实验站海南省香蕉遗传改良重点实验室 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2018年第37卷第10期

页      面：4391-4397页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31501371) 海南省自然科学基金项目(317226)共同资助 

主　　题：香蕉 生长素响应因子 ARF 克隆 序列分析 

摘      要：利用PCR方法从香蕉中克隆了一个生长素响应因子基因,命名MaARF19-1,并对其进行序列分析。结果表明,该基因全长3 411 bp,编码1 136个氨基酸,分子量为126 578.50 u,理论等电点pI为6.26;MaARF19-1蛋白的氨基酸组成中,Gln占比13.12%为最高,Trp占比1.06%为最低,其亲水性氨基酸均匀分布在整个肽链中,多于疏水性氨基酸;通过Motif Search工具发现了B3、Auxin＿resp、AUX＿IAA family3个结构域,序列观察还发现一段Q-富集区,表明该蛋白为具有转录激活功能的生长素响应因子;多序列比对和进化树分析表明,MaARF19-1编码的蛋白与其他植物中ARF19编码的蛋白具有较高的一致性。