中华鳖(Pelodiscus sinensis)肝脏cDNA文库的构建和EST序列的初步分析

作     者：张海琪 何中央 邵健忠 钱国英 张超 

作者机构：浙江大学生命科学学院杭州310058 浙江省水产技术推广总站杭州310012 浙江万里学院宁波315100 

出 版 物：《海洋与湖沼》 (Oceanologia Et Limnologia Sinica)

年 卷 期：2012年第43卷第6期

页      面：1286-1291页

核心收录：

学科分类：0906[农学-兽医学] 09[农学] 

基　　金：浙江省水产新品种选育重大科技专项资助项目"中华鳖新品种选育技术集成与示范" 2012C12907-1号 浙江万里学院省重中之重学科开放基金资助项目 KF2011003号 

主　　题：中华鳖 肝脏 cDNA文库 EST 抗菌肽基因 

摘      要：采用Superscript cDNA全长文库构建法构建了高质量的中华鳖肝脏cDNA文库,GO法对ESTs进行注释。结果表明,文库容量为2.982×106CFU/ml,重组率93%,平均插入片段约为1kb。测序获得了4146个有效序列,发现1957条单基因簇,包括404个序列重叠群和1553条单一序列。279个基因簇得到基因注释,发现了多种与育种价值相关的基因,如泛素、热休克蛋白等抗逆基因、金属硫蛋白等抗金属基因、超氧化物歧化酶、CD9等免疫相关基因,为中华鳖分子遗传学研究、种质资源评价和分子选育等奠定了基础。