大豆过敏原11S球蛋白G2中A2链结合表位的预测
Mapping of Ig G-Binding Epitopes on the A2 Chain of the Major Soybean Allergen 11S Globulin G2作者机构:河北农业大学食品科技学院河北保定071000
出 版 物:《食品科学》 (Food Science)
年 卷 期:2018年第39卷第18期
页 面:152-158页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 0832[工学-食品科学与工程(可授工学、农学学位)] 08[工学] 0805[工学-材料科学与工程(可授工学、理学学位)] 0714[理学-统计学(可授理学、经济学学位)] 083202[工学-粮食、油脂及植物蛋白工程]
基 金:河北省食品科学与工程学科"双一流"建设基金项目(2016SPGCA18)
主 题:大豆过敏原 11S球蛋白G2中A2链 生物信息学软件 蛋白质二级结构 三级结构模型 B细胞表位
摘 要:采用生物信息学软件NCBI Gen Bank数据库、PDB数据库、SWISS-MODEL、Deep View 4.1等预测11S球蛋白G2中A2链的二级结构和三级结构模型,使用Disco Tope 2.0 Server软件预测B细胞构象表位,发现构象表位多位于无规则卷曲处。定位B细胞线性结合表位,结果表明11S球蛋白G2中A2链的可能线性表位有:^(37)KPDNRIE^(43)、^(79)PSYTNGP^(85)、^(114)SQQRGRSQRP^(123)、^(52)WNPNNK^(57)、^(196)QQGGSQSQKGKQQE^(209)、^(241)QGENEEED^(248)、^(267)RKPQQEEDDDDEEEQ^(281)、^(287)TDKGC^(291)。此表位预测为后续制肽、免疫等操作找出更准确的肽序,以便建立适合我国大豆过敏人群的食品大豆过敏原的检测技术。