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雌激素受体阳性绝经后肥胖乳腺癌的芯片数据分析

Microarray data analysis of estrogen receptor positive-breast cancer in postmenopausal obese women

作     者:陈路嘉 朱彦辉 姚广裕 胡晓磊 伊曼 黄萍妹 叶长生 Chen Lujia;Zhu Yanhui;Yao Guangyu;Hu Xiaolei;Yi Man;Huang Pingmei;Ye Changsheng

作者机构:南方医科大学南方医院乳腺科广东广州510515 

出 版 物:《广州医科大学学报》 (Academic Journal of Guangzhou Medical University)

年 卷 期:2018年第46卷第3期

页      面:12-19页

学科分类:1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基  金:广东省自然科学基金项目(2017A030313563) 

主  题:乳腺癌 雌激素受体阳性 绝经后 肥胖 基因差异表达谱 

摘      要:目的:初步探索雌激素受体(ER)阳性绝经后肥胖乳腺癌的相关基因及可能涉及的信号通路。方法:从GEO公共数据库下载含体质指数(BMI)信息的ER阳性绝经后乳腺癌基因芯片数据集(GSE70947),共获得13例肥胖乳腺癌和38例非肥胖乳腺癌的基因表达谱数据,进行基因差异表达谱和信号通路分析,并通过荧光定量PCR法和Western blotting检测法进行相关验证。结果:基因芯片数据分析显示,566个基因在肥胖乳腺癌中出现差异表达,分别有342个基因上调和224个基因下调。GO分析和Pathway分析发现,细胞功能和信号通路可能参与了ER阳性绝经后肥胖乳腺癌的发生发展过程。荧光定量PCR检测结果显示,MMP14、SLC26A3、COL1A2基因mRNA表达情况与芯片分析结果一致。Western blotting检测结果显示,肥胖乳腺癌的COL1A2蛋白相对表达量更高(P0.05)。结论:本研究分析了ER阳性绝经后肥胖乳腺癌的基因表达谱及可能涉及的信号通路,其中COL1A2基因可能是ER阳性绝经后肥胖乳腺癌的相关基因及潜在的治疗靶点。

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