高分辨率熔解曲线分析幽门螺杆菌左氧氟沙星耐药gyrA基因突变的研究
High-resolution melting curve analysis of levofloxacin-resistant gyrA gene mutation in Helicobacter pylori作者机构:南通大学附属东台医院 南通大学附属东台医院消化内科江苏盐城224200
出 版 物:《中华生物医学工程杂志》 (Chinese Journal of Biomedical Engineering)
年 卷 期:2018年第24卷第2期
页 面:85-90页
学科分类:100208[医学-临床检验诊断学] 1002[医学-临床医学] 10[医学]
基 金:2017年高层次卫生人才'六个一工程'拔尖人才项目(LGY2017047)%江苏省卫生计生委2015年度指导性科研课题(Z201527)%盐城市科技计划项目(YK2014088、YK2015086)
主 题:螺杆菌,幽门 耐药 左氧氟沙星 基因 突变 高分辨率熔解曲线
摘 要:目的 优化和建立PCR-高分辨率熔解曲线(HRM)的方法,分析幽门螺杆菌左氧氟沙星耐药基因gyrA基因突变,为临床选择个体化的幽门螺杆菌根除方案提供帮助.方法 收集2013年5月至2013年10月南通大学附属东台医院消化内科进行胃内窥镜检查的45例消化性溃疡患者的胃黏膜组织,微需氧条件(5%O2、10%CO2、85%N2)下培养出23株幽门螺杆菌临床分离菌株,采用E-test法进行左氧氟沙星药敏试验.提取患者胃黏膜组织和临床分离菌株DNA,PCR扩增gyrA基因部分片段后进行序列分析,采用PCR-HRM分析gyrA基因突变.结果 左氧氟沙星的耐药率为47.8%(11/23).11株耐药菌株中10株菌株gyrA基因发生突变,突变形式主要为C261A、G271T、A272G+G514A.9.1%(1/11)耐药菌株和所有敏感菌株gyrA基因均未发生突变.PCR-HRM方法的特异度和重复性均为100%,最低检测限为102 copies/μl.结论 PCR-HRM方法能准确、快速检测幽门螺杆菌gyrA基因突变.