基于转录组测序的山茱萸转录因子CobHLH34的克隆与分析

作     者：侯典云 李炯 杨萌萌 张红晓 胥华伟 赵杏利 Hou Dianyun;Li Jiong;Yang Mengmeng;Zhang Hongxiao;Xu Huawei;Zhao Xingli

作者机构：河南科技大学农学院洛阳471023 洛阳市道地药材繁育与创新利用工程技术研究中心洛阳471023 河南省农业厅中药材生产技术服务中心郑州450000 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2018年第37卷第8期

页      面：3460-3465页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(U1404829) 河南省教育厅自然科学研究计划重点项目(14A180006) 河南省教育厅自然科学研究计划重点项目(12B180007)共同资助 

主　　题：山茱萸 CobHLH34 基因克隆 序列分析 

摘      要：山茱萸为中国常用的药食同源的中药材之一,是很多复方中药的主要成分,同时也是园林绿化的常用树种,应用非常广泛。近几年,山茱萸在降血糖、降血脂以及抗血栓等方面的功效备受关注。为深入研究b HLH类转录因子参与调控山茱萸有效成分合成途径的分子机制,本研究在对山茱萸果实开展转录组测序的前提下,以转录本unigene c98416_g2为参考序列,设计特异引物,通过RT-PCR技术,扩增山茱萸的b HLH34转录因子,命名为Cob HLH34,采用DNAstar、Protparatam和psipred等在线分析软件,解析该序列的分子组成、蛋白的分子量以及二级结构预测,结果表明：山茱萸Cob HLH34的c DNA序列长度为740 bp,其ORF序列编码232个氨基酸,理论等电点为7.95,α-螺旋和无规则卷曲是Cob HLH34蛋白的主要组成部分。基于NCBI-Blast比对和MEGA 6.0构建的系统进化树显示,就Cob HLH34而言,山茱萸与橡胶树、胡桃和狭叶羽扇豆聚为一支,具有较高的同源性。本研究有助于探讨Cob HLH34的功能。