结核分支杆菌Rv1166的T细胞抗原表位预测分析
Prediction and analysis of the distribution of T cell epitopes of the Mycobacterium tuberculosis Rv1166作者机构：武汉轻工大学生物与制药工程学院湖北武汉430023
出 版 物：《武汉轻工大学学报》 (Journal of Wuhan Polytechnic University)
年 卷 期：2018年第37卷第3期
页 面：43-46,97页
学科分类：0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学]
基 金：国家科技重大专项(2017ZX102013010-003-003)
摘 要：预测和分析结核分枝杆菌Rv1166的CD4^+T和CD8^+T细胞表位,并找出优势表位。先通过NCBI数据库获取目的基因的氨基酸序列,再与结核分枝杆菌复合群以及人类基因进行BLAST同源比对。然后使用Net MHC预测和分析目的基因的CD4^+T细胞表位,再通过Net MHC、BIMAS、SYFPEITHI、Net CTL四款在线软件预测和分析CD8^+T细胞表位。最后综合二者的预测结果,找出优势表位。结果为:Rv1166具有免疫原性,综合CD4^+T和CD8^+T细胞表位得到优势表位RLWNMSTVL。这个优势候选表位将作为结核特异诊断和多表位结核疫苗的研究基础。
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