陆地棉GhDHN1基因结构及内含子生物信息学分析

作     者：王俊娟 郭丽雪 陆许可 阴祖军 王德龙 陈修贵 王帅 樊伟丽 陈超 叶武威 Wang Junjuan;Guo Lixue;Lu Xuke;Yin Zujun;Wang Delong;Chen Xiugui;Wang Shuai;Fan Weili;Chen Chao;Ye Wuwei

作者机构：中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室/农业部棉花生物学与遗传育种重点实验室河南安阳455000 

出 版 物：《中国棉花》 (China Cotton)

年 卷 期：2018年第45卷第6期

页      面：10-11,28页

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：国家重点研发计划"七大农作物育种"(2016YFD0100203) 

主　　题：陆地棉 脱水素基因GhDHN1 基因结构 内含子 生物信息学分析 

摘      要：利用生物信息学方法分析陆地棉脱水素基因GhDHN1的DNA序列结构特性,预测其功能。序列分析表明,GhDHN1基因的基因组DNA中AT碱基含量为52.16%,而内含子具有较高的AT碱基含量(63.33%);GhDHN1基因不含CpG岛;其内含子序列含有核心启动子元件TATA框、启动子的增强子元件CAAT框,并含有参与光响应的保守DNA模块的部分元件(Box4)、赤霉素响应元件GARE-motif、生长素响应元件TGA元件等,说明该内含子可能参与了该基因的转录活动,可能受光、激素的诱导;GhDHN1内含子具有GT-AG规则的保守序列,推测GhDHN1基因具有保守的内含子剪接机制。