微囊藻群体总RNA提取方法的比较

作     者：高胜玲 黄亚新 卢亚萍 施丽梅 孔繁翔 张小倩 GAO Shengling;HUANG Yaxin;LU Yaping;SHI Limei;KONG Fanxiang;ZHANG Xiaoqian

作者机构：南京农业大学生命科学学院南京210095 中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊与环境国家重点实验室南京210008 

出 版 物：《湖泊科学》 (Journal of Lake Sciences)

年 卷 期：2018年第30卷第2期

页      面：441-448页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 0830[工学-环境科学与工程（可授工学、理学、农学学位）] 0709[理学-地质学] 0908[农学-水产] 07[理学] 0707[理学-海洋科学] 09[农学] 0815[工学-水利工程] 0903[农学-农业资源与环境] 0704[理学-天文学] 0713[理学-生态学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31370509) 江苏省自然科学基金项目(BK20131466)联合资助 

主　　题：微囊藻群体 RNA提取 qPCR 多糖 

摘      要：微囊藻群体富含多糖类物质是影响微囊藻RNA提取的关键因素.为了获得高质量的微囊藻群体总RNA,对比分析4种针对多糖含量较高的方法——方法 1 PGTX-bead法、方法 2 CTAB-bead法、方法 3 Fast RNAPro Blue Kit和方法 4RNeasy Mini Kit对微囊藻群体总RNA的提取效果.采用琼脂糖凝胶电泳检测微囊藻群体RNA的完整性,Nanodrop ND1000分光光度计检测RNA纯度及浓度,并采用q PCR检测DNA污染情况.结果表明,4种方法都能从微囊藻群体中提取获得RNA,并在去除DNA后都可以进行RT-PCR等后续实验.方法 1 PGTX-bead提取的RNA产量最高,纯度好,DNA污染小,成本低,适合从微囊藻群体中大量提取RNA;方法 2 CTAB-bead提取的RNA样品产量也较高,但DNA污染严重,适合需要同时提取DNA和RNA的样本;方法 3 Fast RNAPro Blue Kit和方法 4 RNeasy Mini Kit提取的RNA产量都较低,但方法 4操作简单,耗时短,所检测目的基因的相对表达量较高,更适合从少量的微囊藻群体中提取总RNA.