怒江大峡谷怒江州段土壤放线菌多样性

作     者：徐方继 李桂鼎 李沁元 陈秀 姜成林 姜怡 XU Fang-Ji;LI Gui-Ding;LI Qin-Yuan;CHEN Xiu;JIANG Cheng-Lin;JIANG Yi

作者机构：云南大学生命科学学院云南省微生物研究所云南昆明650091 东北大学生命与健康学院微生物药物研究所辽宁沈阳110819 云南大学生命科学学院实验中心云南昆明650091 

出 版 物：《微生物学通报》 (Microbiology China)

年 卷 期：2018年第45卷第2期

页      面：250-265页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(31460005 31270001)~~ 

主　　题：怒江大峡谷 土壤 放线菌多样性 16S rRNA基因 

摘      要：【背景】怒江大峡谷怒江州段凭借独特的地理环境、丰富的动植物多样性以及极少的人为干扰,拥有很高的生物多样性调查价值,但对于该生境中的放线菌多样性研究尚未见相关报道。【目的】研究怒江大峡谷怒江州段土壤放线菌多样性情况。【方法】利用Illumina Hi Seq平台对怒江州段土壤样品放线菌免培养多样性进行高通量测序,通过相对丰度、物种聚类、主成分分析对不同样品中放线菌组成及其相似性进行了分析。同时通过9种不同类型培养基结合有效的预处理方法和非目的菌抑制剂进行放线菌的纯培养分离。【结果】高通量测序共获得Tag数目474 203条,OTU数目15 671个,它们分布于细菌域下的47个门90个纲170个目320个科561个属。通过不同样品的比较,发现BS、F-G、F-L、L样品的放线菌免培养多样性普遍优于丙中洛样点的BB、BT、BH样品。纯培养分离共获得351株放线菌,分布于放线菌纲下8个目14个科26个属。所用9种培养基中,YIM171培养基的分离效果最好。通过比较不同样品的放线菌纯培养多样性,丙中洛混合样明显优于其他样品。【结论】怒江大峡谷怒江州段土壤样品中放线菌多样性丰富,应进一步挖掘其放线菌资源潜力,为今后放线菌次生代谢产物的开发提供有效的菌株资源。