基于全基因组测序的MutMap方法在正向遗传学研究中的应用

作     者：袁金红 李俊华 袁娇娇 贾克利 李书粉 邓传良 高武军 Jinhong Yuan;Junhua Li;Jiaojiao Yuan;Keli Jia;Shufen Li;Chuanliang Deng;Wujun Gao

作者机构：河南师范大学生命科学学院新乡453007 

出 版 物：《遗传》 (Hereditas（Beijing))

年 卷 期：2017年第39卷第12期

页      面：1168-1177页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金-河南人才培养联合基金项目(No.U1504319) 国家自然科学基金项目(No.31670317) 河南省高等学校重点科研项目计划项目(No.15A180044) 河南省高校科技创新团队支持计划基金项目资助(No.17IRTSTHN017)~~ 

主　　题：MutMap 突变体 数量性状位点 全基因组重测序 

摘      要：在传统的正向遗传学分析过程中,基因定位需要构建复杂的后代群体,并借助大量分子标记进行遗传连锁分析和区间定位,使得这一过程成本高且耗时长。MutMap是近年来发展的基于高通量第二代测序技术的一种新的正向遗传学分析方法。该方法的优点是遗传定位的周期短且效率高。在此基础上扩展的新方法也不断出现,如基于自交的MutMap+、用于识别基因组缺失区间变异的MutMap-Gap、以及用于定位数量性状基因座的分析思路与MutMap类似的QTL-seq方法等。这些方法不需要建立繁琐的定位群体,甚至不依赖于遗传杂交和任何连锁信息即可进行,加快了对感兴趣表型的变异位点所在基因组区域的识别过程。本文对MutMap及其扩展方法进行了介绍,并对它们未来的应用和发展前景进行了讨论,以期为基于第二代测序技术的正向遗传学基因定位和作物遗传改良研究提供参考。