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多个连锁数量性状位点的多性状最优化选择(英文)

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Acta Genetica Sinica 2006年第3期33卷 220-229页

作者：唐国庆李学伟四川农业大学动物科技学院雅安625014

一种扩展的方法能够在多个世代对具有多个数量性状位点的多性状选择进行最优化。这种方法的基础足在目标函数中用综合遗传值替代单个性状遗传值,并在整个规划期内最大化所有世代选择反应的加权和。利用多阶段系统优化控制理论,整个最优... 详细信息

一种扩展的方法能够在多个世代对具有多个数量性状位点的多性状选择进行最优化。这种方法的基础足在目标函数中用综合遗传值替代单个性状遗传值,并在整个规划期内最大化所有世代选择反应的加权和。利用多阶段系统优化控制理论,整个最优化问题通过一个向前和向后的迭代循环解决。用一个实际育种猪群的育种参数来评价该方法的选择效果, 并和标准QTL选择和常规BLUP选择进行比较。结果表明,优化选择要优于标准QTL选择和常规BLUP选择。经济权重对优化选择的影响较明显,随着达100kg日龄赋予的经济权重的增加,优化选择的优势越明显。优化选择通过两种方式增加总选择反应:1)选择早期减少一部分QTL选择反应;2)对达100 kg 日龄给予更大的权重。选择后期优化累积贴现选择比优化终端选择给予达100kg日龄更大的权重。

关键词：最优化基因辅助选择数量性状位点 BLUP

柑橘果实大小与质量的遗传分析和数量性状位点定位

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浙江大学学报（农业与生命科学版） 2021年第6期47卷 719-728页

作者：罗艾龚桂芝彭祝春杨程常珍珍洪棋斌西南大学柑桔研究所/中国农业科学院柑桔研究所重庆400712

为探究柑橘果实大小与质量的遗传调控机制,开展了果实大小和质量的数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位分析,以挖掘调控基因。以‘晚蜜2号’和‘梨橙2号’的94株F1代材料为分离群体,采用保守同源序列(conserved ortholog se... 详细信息

为探究柑橘果实大小与质量的遗传调控机制,开展了果实大小和质量的数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位分析,以挖掘调控基因。以‘晚蜜2号’和‘梨橙2号’的94株F1代材料为分离群体,采用保守同源序列(conserved ortholog sequence,COS)和微卫星标记即简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)构建遗传连锁图谱,测定单株成熟果实大小和质量等性状,并进行遗传传递力分析和QTL定位分析。结果表明:本研究构建了一张包含201个标记、10个连锁群,总长为1194.5 cM的柑橘遗传连锁图谱;定位到与果实质量相关的4个QTLs,与横径相关的3个QTLs,与纵径相关的4个QTLs,都分别位于WL3和WL8连锁群上。通过对这些区域内的编码基因进行挖掘,发现了一些与果实发育相关的候选基因:GATA转录因子、生长素响应因子(auxin response factor,ARF)和GDSL酯酶。本研究鉴定到的QTLs和候选基因可为柑橘果实大小和质量的遗传研究、育种和物种改良提供理论参考和分子标记工具。

关键词：柑橘果实大小果实质量遗传图谱数量性状位点

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水稻耐盐性数量性状位点的初步检测

中国水稻科学 2000年第2期14卷 65-70页

作者：顾兴友梅曼彤严小龙郑少玲卢永根华南农业大学农学系

用RFLP分析技术和分蘖株系法对由耐盐性品种Pokkali和盐敏感品种Peta配制的BC1 (Peta/Pokkali∥Peta)群体分别检测水稻苗期和成熟期耐盐性数量性状位点 (QTLs)。表型鉴定在含 (处理 )或不含 (对照 ) 6 0mol/m3NaCl的营养液中进行 ,苗期... 详细信息

用RFLP分析技术和分蘖株系法对由耐盐性品种Pokkali和盐敏感品种Peta配制的BC1 (Peta/Pokkali∥Peta)群体分别检测水稻苗期和成熟期耐盐性数量性状位点 (QTLs)。表型鉴定在含 (处理 )或不含 (对照 ) 6 0mol/m3NaCl的营养液中进行 ,苗期观测盐害级别、苗Na+ 含量和鲜重 /干重比值 3项指标 ,成熟期测定 1 0种农艺性状处理与对照的相对值。从水稻 1 2条染色体上筛选出 43个多态性标记 ,对上述指标分别作点分析 ,共检出 1 5个连锁标记。连锁标记的分布特点显示 ,在研究所涉及的基因组范围内存在 4个影响苗期耐盐性的QTL ,其增效等位基因均来自耐盐品种Pokkali;影响成熟期耐盐性的QTL分布于 7条染色体的 1或 2个连锁区间上 ,其有利基因来自双亲 ;RG6 78和RZ40 0B～RZ792附近的

关键词：水稻数量性状位点耐盐性 RFLP标记

在猪12号染色体上定位数量性状位点(英文)

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Acta Genetica Sinica 2000年第10期27卷 858-865页

作者：岳根华 H Bartenschlager G Moser H Geldermann 新加坡农业分子生物学院 Department of Animal Breeding and Biotechnology Institute of Animal Husbandary and Animal Breeding Uinversity of Hohenheim

为了找出猪１２号染色体上的数量性状位点，在２个家系中测定了１０个遗传标记，并记录了５１个重要经济性状。该２家系，一个由欧洲野猪与皮特兰杂交而成，另一个由梅山与皮特兰杂交建成。应用最小二乘法进行了数量性状位点定位，同时... 详细信息

为了找出猪１２号染色体上的数量性状位点，在２个家系中测定了１０个遗传标记，并记录了５１个重要经济性状。该２家系，一个由欧洲野猪与皮特兰杂交而成，另一个由梅山与皮特兰杂交建成。应用最小二乘法进行了数量性状位点定位，同时进行了生长激素基因型与性状间的相关分析。应用最小二乘法并未发现数量性状位点，而应用相关分析发现生长激素基因型与某些膘情性状高度相关。带有基因型Ｃ１Ａ２／Ｃ４Ａ２的猪比带有基因型Ｃ２Ａ２／Ｃ２Ａ２的猪背膘薄近１ｃｍ（２１．７６对３１．４１ｍｍ）。

关键词：数量性状位点生长激素基因 12号染色体猪

使用极端样本构建一个基于熵的对数量性状位点关联研究的统计量(英文)

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生物数学学报 2008年第4期23卷 605-611页

作者：向阳李玉梅刘再明怀化学院数学系湖南怀化418008 中南大学数学学院湖南长沙410081 中南大学公共卫生学院湖南长沙410078

基于熵理论,Zhao等提出了一个对复杂疾病易感基因进行关联研究的统计量.本文拓展了这一理论到数量性状,利用熵理论,获得了一个对数量性状位点进行关联研究的采用群体极端样本及稠密标记的统计量.

关键词：熵数量性状位点关联研究极端样本

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影响小麦加工品质数量性状位点的研究

南开大学学报（自然科学版） 2006年第6期39卷 6-12页

作者：陈喜文刘晓光陈德富陈飞雪南开大学生命科学学院天津300071 内蒙古商法专修学院内蒙古呼和浩特010000

以M 5和M 16为亲本构建的重组自交系为材料,对影响小麦加工品质性状的数量性状位点(QTL)进行了研究.检测了群体中籽粒硬度、蛋白质含量、SDS沉降值、拉伸面积等品质性状,它们在群体中呈近似正态的连续分布,为多基因控制的数量性状.利用4... 详细信息

以M 5和M 16为亲本构建的重组自交系为材料,对影响小麦加工品质性状的数量性状位点(QTL)进行了研究.检测了群体中籽粒硬度、蛋白质含量、SDS沉降值、拉伸面积等品质性状,它们在群体中呈近似正态的连续分布,为多基因控制的数量性状.利用43个SSR标记和42个AFLP标记构建了相关染色体的分子连锁图.在1A、5D、6D染色体上分别检测到与籽粒硬度相关的QTL各1个,其中位于染色体5D上的X gw n190对表型变异的贡献率最大,达62.5%,为主效基因;在1B和6A染色体上分别检测到与蛋白质含量相关的QTL各1个,它们对表型变异的贡献率分别为13.2%和15.6%;在染色体1B和3B上分别检测到与SDS沉降值相关的QTL各1个,贡献率最大(10.2%)的一个QTL位于3B染色体上靠近E 37M 61-286的区域;在1A、3B、5D染色体上分别检测到与拉伸面积相关的QTL各1个,其中5D染色体上的X gw n190对表型的贡献率最大,为11.5%.

关键词：小麦面包加工品质分子连锁图数量性状位点

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蚊虫抗拟除虫菊酯数量性状位点的研究进展

重庆师范大学学报（自然科学版） 2016年第6期33卷 26-31页

作者：刘柏琦陈斌乔梁重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室重庆401331

蚊虫是重要的医学昆虫,对人类危害极大。近些年来,由于拟除虫菊酯杀虫剂的广泛使用,导致蚊虫体内产生了抗药性。为了解析抗药性的分子基础和遗传特性,当前采用了一种新的方法即数量性状位点(Quantitative trait loci,QTL)定位。综述了... 详细信息

蚊虫是重要的医学昆虫,对人类危害极大。近些年来,由于拟除虫菊酯杀虫剂的广泛使用,导致蚊虫体内产生了抗药性。为了解析抗药性的分子基础和遗传特性,当前采用了一种新的方法即数量性状位点(Quantitative trait loci,QTL)定位。综述了近些年来蚊虫抗拟除虫菊酯QTL的研究的最新进展,包括蚊虫QTL定位研究的理论基础、QTL定位鉴定抗性位点、抗性基因差异表达分析及功能调控。蚊虫抗拟除虫菊酯QTL的研究发展迅速,相关研究成果对蚊虫的防治和病媒疾病的控制具有重要意义;在现有方法的基础上,可以利用高通量测序和关联分析来深入解析蚊虫QTL,为进一步探究蚊虫抗药性提供新的契机。

关键词：蚊虫抗拟除虫菊酯数量性状位点抗性基因比较分析

不同生长环境下水稻结实率数量性状位点的检测

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作物学报 2006年第7期32卷 1024-1030页

作者：韩龙植张三元乔永利金钟焕徐福荣曹桂兰南钟浩戴陆园芮钟斗高熙宗中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程/农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室北京100081 吉林省农业科学院水稻研究所吉林公主岭136100 韩国农村振兴厅作物科学院云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南昆明650205 首尔大学校农业生命科学大学农学科

以籼稻密阳23与粳稻吉冷1号配制所获得的R2：3群体200个家系作为作图群体，在北京、昆明、三亚、公主岭和韩国春川等5个点进行水稻结实率的鉴定，并利用SSR标记对水稻结实率数量性状位点进行检测。结果表明，水稻结实率表型值及其在B家... 详细信息

以籼稻密阳23与粳稻吉冷1号配制所获得的R2：3群体200个家系作为作图群体，在北京、昆明、三亚、公主岭和韩国春川等5个点进行水稻结实率的鉴定，并利用SSR标记对水稻结实率数量性状位点进行检测。结果表明，水稻结实率表型值及其在B家系群中的分布以及所检测到的QTL数目因生长环境不同而有较大差异，说明QTL与环境有明显的互作效应。水稻结实率在F3家系群中呈接近正态或偏态的连续分布，是由多个基因所控制的数量性状。共检测到与水稻结实率相关的QTL14个，分布于第1、2、3、4、6、7、8、10和12染色体上，对表型变异的贡献率为4．9％。15．3％。分别位于第1、2、6和12染色体RM1-RM259、RM263～RM6、RM340-RM30、RM270～RMl7区间的qSSR1、qSSR2、qSSR6和口SSRl2至少在2种生长环境下均检测到，对表型变异的贡献率分别为4．9％～8．4％、4．8％。7．2％、7．6％。10．7％和7．4％。10．4％。以上多数QTL增效等位基因均来自吉冷1号，基因作用方式主要为部分显性或显性或超显性。

关键词：水稻结实率不同生长环境数量性状位点微卫星标记

应用分子标记研究水稻根系形态特征数量性状位点

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作物学报 1999年第2期25卷 181-185页

作者：方萍吴平陶勤南浙江农业大学土壤与农业化学系浙江杭州310029 浙江农业大学生物科学技术系浙江杭州310029

通过水培试验测定水稻F_3群体(Palawan×IR42)137株系的幼苗根体积、根表面积、相对根粗、最大根长和根数等根系形态特征.借助由该组合的F_2群体所构建的RFLP标记连锁图,通过方差分析检测与根系形态特征表型值相关连的分子标记位点,共测... 详细信息

通过水培试验测定水稻F_3群体(Palawan×IR42)137株系的幼苗根体积、根表面积、相对根粗、最大根长和根数等根系形态特征.借助由该组合的F_2群体所构建的RFLP标记连锁图,通过方差分析检测与根系形态特征表型值相关连的分子标记位点,共测得7个标记位点分别与3个表型性状关连.其中位于2号染色体上的2对连锁标记位点RG139与RZ742及RG171与RG544跟根体积关连;位于5号染色体上的标记位点CDO105与相对根粗关连;2号染色体上的标记位点RG139及5号染色体上的1对连锁标记位点RG229与RG13跟最大根长关连.这些标记位点对关联的表型性状都具有显著的加性效应.

关键词：水稻根系形态特征数量性状位点标记