基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的高邮湖湖鲚(Coilia nasus)遗传多样性分析

作     者：李大命 张彤晴 关浩勇 唐晟凯 刘燕山 刘小维 潘建林 LI Da-ming;ZHANG Tong-qing;GUAN Hao-yong;TANG Sheng-kai;LIU Yan-shan;LIU Xiao-wei;PAN Jian-lin

作者机构：江苏省淡水水产研究所江苏省内陆水域渔业资源重点实验室南京210017 

出 版 物：《淡水渔业》 (Freshwater Fisheries)

年 卷 期：2017年第47卷第6期

页      面：3-8页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：江苏省海洋与渔业资源环保项目“江苏省水生生物资源重大专项(ZYHB16-3)” 

主　　题：湖鲚(Coilia nasus) 遗传多样性 线粒体DNA 细胞色素b基因 控制区序列 

摘      要：本研究利用线粒体细胞色素b(Cytb)基因和控制区(D-loop)序列作为分子标记,调查了高邮湖湖鲚(Coilia nasus)种群遗传多样性。结果显示,Cytb基因和D-loop区序列碱基A+T含量均高于G+C含量,显示碱基组成具有偏倚性。38条Cytb基因序列检出26个变异位点,定义13个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.716±0.078和0.002 70±0.000 57;40条D-loop区序列检出53个变异位点,定义21个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.906±0.034和0.006 27±0.000 99。13个Cytb基因单倍型之间的遗传距离在0.001~0.014之间,NJ系统进化树显示单倍型聚为1支;21个D-loop区单倍型之间的遗传距离在0.001~0.019之间,NJ系统进化树显示单倍型聚为2支。中性检测结果和歧点分布图均表明高邮湖湖鲚种群稳定,近期没有发生种群扩张。整体来看,高邮湖湖鲚种质资源遗传多样性水平较高,具有高单倍型多样性和低核苷酸多样性的特征。