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常见病原真菌鉴定基因芯片方法的建立

The establishment of a gene microarray for detecting the common pathogenic fungi

作     者:邓冠华 郑璇 周新 胡一敏 谢焱 刘松梅 DENG Guan-hua;ZHENG Xuan;ZHOU Xin;HU Yi-min;XIE Yan;LIU Song-mei

作者机构:武汉大学中南医院基因诊断中心430071 广州阳普医疗科技股份有限公司 

出 版 物:《中华检验医学杂志》 (Chinese Journal of Laboratory Medicine)

年 卷 期:2011年第34卷第12期

页      面:1114-1118页

核心收录:

学科分类:100208[医学-临床检验诊断学] 1002[医学-临床医学] 10[医学] 

主  题:真菌 寡核苷酸序列分析 核酸杂交 

摘      要:目的 建立临床常见的病原真菌的基因芯片检测体系.方法 选取8种临床常见真菌,包括白色假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌、热带假丝酵母菌、近平滑假丝酵母菌、土曲霉、黄曲霉、米根霉和烟曲霉.根据真菌ITS区设计引物和探针,进行扩增和芯片制备.通过将待检真菌的PCR产物变性后与点布探针的芯片杂交,观察并分析荧光信号强度,进行对真菌的快速检测.并选取临床真菌阳性标本和细菌阳性标本共25份进行验证.结果 25份临床阳性标本的芯片检测结果显示,10份细菌阳性的标本,经真菌基因芯片检测,全部为阴性,无荧光信号.其余15份真菌标本中,12份临床真菌阳性标本均鉴定出芯片中的某一种真菌的结果.另外采用克柔假丝酵母菌人为制备的3份待检样本,经检测,芯片中8种真菌位点无荧光信号,为阴性,仅有真菌通用探针得到荧光信号,表明该标本中有真菌存在,但无法确认是哪一种.结论 本研究建立的基因芯片可对常见病原真菌进行快速准确的鉴定,为基因芯片应用于临床奠定了基础.

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