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大肠杆菌启动子特征元件对启动子识别的影响

The Influence of E. Coli Promoter Feature Elements on Promoter Recognition

作     者:冉令华 阮晓钢 RAN Ling-hua;RUAN Xiao-gang

作者机构:北京工业大学电子信息与控制工程学院北京100022 

出 版 物:《北京工业大学学报》 (Journal of Beijing University of Technology)

年 卷 期:2005年第31卷第2期

页      面:126-129页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 

基  金:国家自然科学基金资助项目(60234020) 

主  题:神经网络 大肠杆菌 启动子 

摘      要:为了进一步研究大肠杆菌启动子的识别算法,根据大肠杆菌基因分子生物学有关理论与统计事实,对大肠杆菌启动子特征元件进行了研究.从启动子样本中选取不同的保守序列,采用2种神经网络结构.分别分析了启动子特征元件对识别的影响.研究发现.包含-10和-35区2个显著保守序列元件及其他几个非显著序列元件时,正样本和负样本的识别率最高,达到77.67%和88.45%.实验结果为进一步研究启动子的特征提取和识别算法提供了参考.

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