基于线粒体16S rRNA探讨渤海海区矮拟帽贝的种群生态遗传
Population Ecological Genetics of Patelloida pygmaea Based on Mitochondrial 16S rRNA Fragment Sequences in the Bohai Sea作者机构:烟台大学生命科学学院山东烟台264005 海南热带海洋学院海南两栖爬行动物研究重点实验室海南三亚572000
出 版 物:《四川动物》 (Sichuan Journal of Zoology)
年 卷 期:2017年第36卷第4期
页 面:386-391页
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖]
基 金:国家自然科学基金地区基金项目(31460562) 烟台大学博士科研启动经费(SM15B01) 烟台大学研究生科技创新基金项目 烟台大学开放实验室项目 2016年国家级大学生创新创业训练计划项目(201611066009)
摘 要:采用聚合酶链式反应和直接测序的方法研究了渤海海区15个矮拟帽贝Patelloida pygmaea种群遗传多样性与环境因子的关系。180个个体的16S rRNA部分序列(615 bp)共发现264个多态性位点,153个转换,114个颠换,界定32个单倍型。所有个体碱基含量依次为C(18.12%)、T(27.74%)、A(33.07%)、G(21.07%);单倍型多样性为0.835 1±0.019 1,核苷酸多样性为0.449±0.214。矮拟帽贝大陆沿岸种群核苷酸多样性(0.191 8±0.091 7)高于岛屿种群(0.107 3±0.081 6)。种群历史动态结果显示,矮拟帽贝经历了种群近期扩张。与环境因子相关性研究发现,遗传距离、序列变异、核苷酸多样性与日照时数、日照百分率分别呈显著正相关(P0.05);形态相关分析结果表明,变异主成分(壳长、壳宽)与年均降水量呈显著负相关(P0.05);年均降水量、日照时数、日照百分率是影响矮拟帽贝形态变异、遗传多样性的主导因子,环境越稳定地区种群的遗传多样性越高。