引物选择对污泥微生物多样性分析的影响

作     者：徐爱玲 吴等等 宋志文 任杰 夏岩 董珊珊 刘梦 

作者机构：青岛理工大学环境与市政工程学院青岛266033 

出 版 物：《环境科学》 (Environmental Science)

年 卷 期：2013年第34卷第9期

页      面：3620-3626页

核心收录：

学科分类：0830[工学-环境科学与工程（可授工学、理学、农学学位）] 07[理学] 0713[理学-生态学] 

基　　金：山东省自然科学基金项目(ZR2011EEQ026) 青岛市基础研究计划项目(KJZD-12-51-jch) 国家自然科学基金项目(31170509/C031303) 

主　　题：活性污泥 微生物多样性 PCR-DGGE PCR-RFLP 引物 

摘      要：研究不同引物对PCR-DGGE和PCR-RFLP技术分析污泥群落结构的影响,选取8对通用引物扩增16S rDNA不同可变区序列并对细菌多样性进行DGGE分析,也选取11对通用引物扩增16S rDNA片段并对细菌多样性进行RFLP分析.通过分析PCR产物琼脂糖凝胶电泳图谱、DGGE图谱和酶切图谱,评价不同引物的扩增效果及其对污泥群落多样性的表征能力.结果表明,采用不同引物进行污泥群落结构DGGE分析或RFLP分析时,污泥群落多样性差异显著.PCR-DGGE分析中,引物B341F/B534R(V3区)分析效果较好,条带较丰富,能够充分反映污泥群落多样性.PCR-RFLP分析中,引物27f/8f和1500R扩增效果较好,酶切位点较多,酶切图谱条带丰富,差异性显著,能够充分表征污泥群落多样性.因此,活性污泥细菌多样性分析时,PCR-DGGE分析较优的引物为B341F和B534R,PCR-RFLP分析较优的引物为27f/8f和1500R.