基于线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ基因序列的帘蛤科贝类分子系统发育研究

作     者：程汉良 彭永兴 董志国 易乐飞 孟学平 申欣 周旻纯 陈冬勤 

作者机构：淮海工学院江苏省海洋生物技术重点实验室连云港222005 

出 版 物：《生态学报》 (Acta Ecologica Sinica)

年 卷 期：2013年第33卷第9期

页      面：2744-2753页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：江苏省自然科学基金项目资助(BK2008191) 江苏省"六大人才高峰"项目资助(07-G-015) 

主　　题：帘蛤科 线粒体DNA 细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ 系统发生 

摘      要：对21种帘蛤科贝类线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome c oxidase subunit I,COI)基因核苷酸序列进行了分析,以探讨这一序列在种质鉴定、分子系统发生研究中的应用价值。测序结果表明,所有物种扩增片段长度均为707 bp(含引物),序列A+T含量(62.4%—67.8%)明显高于G+C含量。物种间共有变异位点379个,其中简约信息位点334个;此区段共编码235个氨基酸,种间共有氨基酸变异位点100个。以COI基因片段序列为标记,用中国蛤蜊(Mactra chinensis)作外群,构建了35种帘蛤科贝类(其中14种贝类COI序列从GenBank下载)的系统发生树,结合拓扑结构分析和序列比对分析,结果表明:支持将短文蛤(Meretrix petechinalis)和丽文蛤(***)订为文蛤(***)的同物异名的观点,建议将丽文蛤和短文蛤订为文蛤的地理亚种;支持将薄片镜蛤(Dosinia corrugata)和***订为2个独立种的观点;认为将波纹巴非蛤(Paphia undulata)和织锦巴非蛤(***)订为2个独立种是合适的。COI基因序列含有丰富的遗传信息,适合作为帘蛤科贝类种群遗传结构和系统发生研究的分子标记。