大豆DNA去甲基化酶ROS1的生物信息学分析

作     者：梁喜龙 李国兰 崔洪秋 鞠世杰 洪艳华 方淑梅 郑殿峰 HANG Xi-long;LI Guo-lan;CUI Hong-qiu;JU Shi-jie;HONG Yan-hua;FANG Shu-mei;ZHENG Dian-feng

作者机构：黑龙江八一农垦大学农学院黑龙江大庆163319 黑龙江八一农垦大学生命学院黑龙江大庆163319 

出 版 物：《大豆科学》 (Soybean Science)

年 卷 期：2014年第33卷第3期

页      面：321-324,333页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：黑龙江省教育厅科学技术研究项目(12521381) 

主　　题：大豆 DNA去甲基化酶 ROS1 生物信息学分析 

摘      要：利用NCBI、Phytozome、ExPASy等网站及其数据库,初步确定了大豆DNA去甲基化酶ROS1的蛋白及基因序列、基因拷贝数、理化特性等,并进一步预测分析了二级结构及结构域,同时结合Clustal X2.0和MEGA4.0等软件进行多重序列比对和分子系统进化关系研究。结果显示,大豆ROS1包括6个拷贝,ROS1各拷贝的分子量相近,等电点酸性,具有相似的潜在磷酸化位点,属于不稳定的疏水性蛋白,都位于细胞核内,且不含信号序列。α螺旋是主要的二级结构,均含有DNA_glycosylase,HhH-GPD_domain和HTH_base_excis_C三个结构域。