鸽PPARγ基因的克隆、序列分析及组织表达特征
Molecular Cloning, Sequence Analysis and Tissue Distribution of PPARγ Gene in Pigeon （Columba livia）作者机构：浙江省农业科学院畜牧兽医研究所 平阳县星亮鸽业有限公司
出 版 物：《农业生物技术学报》 (Journal of Agricultural Biotechnology)
年 卷 期：2017年第25卷第4期
页 面：628-638页
核心收录：
基 金：浙江省农业(畜禽)新品种选育重大科技专项(No.2016C02054-16) 国家科技部富民强县专项子课题(No.GKZ201405) 浙江省农科院鸽产业团队科技特派员项目(No.22)
主 题：鸽 过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ) 克隆 序列分析 组织表达
摘 要：过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferator activated receptorγ,PPARγ)是一种由配体激活的核转录因子,在脂类代谢调控中发挥重要作用。本研究旨在克隆鸽(Columba livia)PPARγ基因的全长cDNA序列,并分析该基因编码的蛋白质理化性质和结构特征,揭示其组织表达特征。以鸽脾脏组织总RNA为模板,采用快速扩增cDNA末端(rapid amplification cDNA ends,RACE)方法,克隆到PPARγ基因的cDNA序列,并运用生物信息学的方法对其进行分析,运用实时荧光定量PCR检测PPARγ基因在鸽心脏、肝脏、脾脏、肺、肾脏和肌肉组织中的表达情况。研究结果表明,鸽PPARγ基因(Gen Bank ***166859.2)cDNA全长1 846 bp,包含1 428 bp的开放阅读框,63 bp的5’端非编码区和355 bp的3’端非编码区,共编码475个氨基酸。经预测,鸽PPARγ基因编码的蛋白质由7 661个原子组成,分子式为C2436H3840N644O714S27,等电点为6.19,相对分子质量为54.438 79 k D,平均亲水性为-0.287。结构预测表明,鸽PPARγ蛋白具有2个锌指结构以及配体结合域。鸽PPARγ氨基酸序列与杜鹃(Cuculus canorus)、鸭(Anas platyrhynchos)、鹦鹉(Melopsittacus undulates)、斑胸草雀(Taeniopygia guttata)、火鸡(Meleagris gallopavo)、鸡(Gallus gallus)、鹌鹑(Coturnix japonica)、猪(Sus scrofa)、人(Homo sapien)、小鼠(Mus musculus)和斑马鱼(Danio rerio)的同源性分别为97%、97%、96%、96%、96%、96%、96%、92%、91%、90%和64%。构建的系统发生树显示,鸟类和哺乳动物各形成一个大的分支,斑马鱼形成一个独立分支,与鸽的聚类顺序较近的物种为杜鹃和鸭,该结果与这些物种在生物学上的分类是基本一致的。荧光定量PCR结果显示,PPARγ基因在肺组织中的表达量最高,较高表达于肾脏、肝脏、脾脏和心脏,而在肌肉组织中的表达量最低。本研究获得了鸽PPARγ基因的cDNA序列、分子的结构特点及组织表达特征,提示可能与其在不同组织中的功能有关,该结果为进一步研究PPARγ结构和功能提供了理论依据。
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