金花茶CnBCH基因cDNA全长克隆及生物信息学分析

作     者：周兴文 周银慧 赵英 朱宇林 Zhou Xingwen Zhou Yinhui Zhao Ying Zhu Yulin

作者机构：玉林师范学院生物与制药学院玉林537000 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2017年第15卷第1期

页      面：77-83页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 090706[农学-园林植物与观赏园艺] 0907[农学-林学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31360197) 玉林师范学院高层次人才科研启动基金(G20120027)共同资助 

主　　题：金花茶 β-胡萝卜素羟化酶 克隆 

摘      要：利用CODEHOP和RACE方法,从珍稀观赏植物金花茶(Camellia nitidissima)花瓣中克隆得到了β-胡萝卜素环羟化酶(β-carotene hydroxylase,BCH)基因的cDNA全长,命名为CnBCH。碱基序列分析结果表明,该CnBCH基因全长1 089 bp,包含58 bp的5 非翻译区(untranslated regions,UTR)、105 bp的3 UTR和927 bp编码308个氨基酸的开放阅读框。生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白质为不稳定亲水性蛋白,分子量为34.42 k D,无信号肽,含有4个跨膜结构域,一个脂肪酸羟化酶超家族(FA_hydroxylase super family)功能结构域以及BCH功能结构域(PLN02601);CnBCH二级结构以α-螺旋为主,其次为无规则卷曲,β-折叠所占比例最少。氨基酸序列比对分析结果显示,CnBCH与茄科、蔷薇科等植物BCH蛋白同源性都在70%以上,与柿树(Diospyros kaki T.)BCH同源性最高。本研究为进一步了解CnBCH基因的功能及其在金花茶花瓣类胡萝卜素合成中的作用提供了帮助。