逆转录定量PCR选择性检测环境样品中的活性分枝杆菌

作     者：景明 JING Ming

作者机构：苏州环境监测中心苏州215000 同济大学环境科学与工程学院上海200092 

出 版 物：《环境科学学报》 (Acta Scientiae Circumstantiae)

年 卷 期：2015年第35卷第2期

页      面：484-490页

核心收录：

学科分类：082803[工学-农业生物环境与能源工程] 08[工学] 0828[工学-农业工程] 0804[工学-仪器科学与技术] 

基　　金：国家水体污染控制与治理科技重大专项(No.2011ZX07506-003-005)~~ 

主　　题：RT-qPCR 分枝杆菌 活性菌 环境样品 

摘      要：以分枝杆菌(Mycobacterium spp.)为研究对象,建立了一种逆转录定量PCR(Reverse transcription quantitative PCR,RT-q PCR)方法,选择性检测环境样品中的活性分枝杆菌.研究结果表明,稳定期(48~144 h)分枝杆菌细胞内hsp65基因的RNA转录稳定,单位细胞内hsp65的c DNA含量约为1拷贝,以此作为活性分枝杆菌的定量依据,达到快速确定环境样品中活性分枝杆菌浓度的目的.相比q PCR,RT-q PCR方法能够区分3个数量级的非活性分枝杆菌;样品的底物基质对RT-q PCR方法的影响较小;对于实际样品,与q PCR方法相比,RT-q PCR方法检测实际样品中活性分枝杆菌的结果与培养法更接近,线性关系更加显著(R2=0.9390).本研究表明,作为一种新的检测技术,RT-q PCR可以快速、准确地检测环境样品中的活性分枝杆菌.