人MxA基因启动子-88/-123位多态性荧光PCR检测方法的建立及临床应用
Establishment and clinical application of fluorescent polymerase chain reaction for the determination of --88/--123 polymorphisms in the Myxovirus resistance protein A gene promoter作者机构:北京大学深圳医院中心实验室深圳518036 北京大学深圳医院感染性疾病科深圳518036
出 版 物:《中华传染病杂志》 (Chinese Journal of Infectious Diseases)
年 卷 期:2008年第26卷第10期
页 面:580-584页
核心收录:
学科分类:1002[医学-临床医学] 1010[医学-医学技术(可授医学、理学学位)] 100215[医学-康复医学与理疗学] 10[医学]
基 金:广东省医学科学技术研究基金资助项目(A2005643) 深圳市科技计划重点项目(JH200505270415B) 深圳科技计划项目(2003~131)
主 题:蛋白质类 抗病毒药 操纵子 多态现象 遗传 干扰素α-2b
摘 要:目的建立一套快速、灵敏和特异的人抗黏液蛋白A(MxA)基因启动子中干扰素刺激应答元件-88/-123位多态性检测体系,为合理应用IFN—α治疗慢性乙型肝炎提供分子生物学检测手段。方法对经IFN—α治疗的患者进行HBVDNA、HBV基因分型及MxA基因启动子中干扰素刺激应答元件-88/-123位多态性位点检测,确定基因多态性与IFN—α治疗效果之间的关系。通过各种条件优化实验,建立MxA基因启动子中干扰素刺激应答元件-88/-123位多态性荧光PCR检测体系,并通过与DNA序列分析法检测结果的对比,验证荧光PCR检测体系的灵敏性及特异性,从而对该体系的临床适用性进行初步评估。采用卡方检验计算P值、回归分析法计算对比率和95%可信区间。结果MxA基因启动子干扰素刺激应答元件中-88位为G/T杂合型和-123位为C/A杂合型者皆为IFN—α敏感型,-88位为G/G纯合型和-123位为C/C纯合型者为IFN—α不敏感型。与DNA序列分析的金标准相比,荧光PCR检测的符合率为99.65%。结论荧光PCR检测体系,可灵敏、快捷地检测患者MxA基因多态性位点。