小尺度空间果生刺盘孢遗传多样性分析

作     者：汤铱泠 周国英 李河 刘倩丽 罗娜 苏宋淞 

作者机构：中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室长沙410004 中南林业科技大学森林有害生物防控湖南省重点实验室长沙410004 

出 版 物：《植物病理学报》 (Acta Phytopathologica Sinica)

年 卷 期：2016年第46卷第5期

页      面：670-678页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学] 

基　　金：林业公益性行业科研专项(201304403) 

主　　题：油茶炭疽病 果生刺盘孢 遗传多样性 多基因 

摘      要：本研究将来自16个油茶品种的247个Colletotrichum fructicola的多基因序列进行遗传多样性分析,结果表明,247个***多基因序列有21个单倍型,其中Hap2占总数的54.7%,Hap4占总数的34%,为两个主要的单倍型,来自所有16个油茶品种。基本上每一个油茶品种都存在***独特的单倍型。遗传分化系数(Fst)表明不同品种来源菌株种群间存在一定的遗传分化。对所有品种种群进行中性检测及核苷酸不配对分析,发现小尺度空间的果生次盘孢菌经历大规模的种群扩张,群体间存在有效基因流。系统发育分析表明,来自不同品种的菌株散乱地分布在系统发育树中。