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学校人际关系与血清素系统多基因累积遗传风险对青少年抑郁的影响

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心理发展与教育 2024年 436-447页

作者：曾子豪胡义秋刘双金彭丽仪杨琴王宏才何震姚星星湖南师范大学教育科学学院阿姆斯特丹自由大学临床心理学系湖南省心理健康教育研究基地认知与人类行为湖南省重点实验室湖南师范大学心-脑交叉科学研究中心

基于抑郁的人际关系理论与进化模型，采用问卷法和DNA分型技术，对525名青少年进行为期两年的追踪调查，选取关键变量学校人际关系，挫败感和血清素系统多基因构建一个有调节的中介模型，考察遗传与环境的交互作用对抑郁的影响。结果显... 详细信息

基于抑郁的人际关系理论与进化模型，采用问卷法和DNA分型技术，对525名青少年进行为期两年的追踪调查，选取关键变量学校人际关系，挫败感和血清素系统多基因构建一个有调节的中介模型，考察遗传与环境的交互作用对抑郁的影响。结果显示:(1)学校人际关系可以显著预测青少年抑郁;(2)挫败感在学校人际关系对青少年抑郁影响中起中介作用;(3)多基因风险评分(Polygenic Risk Score,PRS)调节同伴关系和挫败感对青少年抑郁的影响，具体表现为，随着PRS得分的增加，挫败感对青少年的影响增强，斜率增加，有着更高的抑郁风险;同伴关系对抑郁的影响表现出类似情况，斜率绝对值增加，负向预测加强，即抑郁得分更低，支持差别易感性模型;(4)敏感性分析结果显示，TPH2基因rs4570625多态性G等位基因是青少年抑郁的重要候选基因，且相比单基因研究，多基因与环境的交互作用对抑郁的解释力和稳定性更强。

关键词：青少年抑郁学校人际关系挫败感血清素多基因

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多基因系统发育分析竹黄的分类地位

菌物学报 2021年第7期40卷 1660-1675页

作者：陶欣赵宁李彪李敏闫淑珍陈双林南京师范大学生命科学学院江苏南京210023 南京师范大学食品与制药工程学院江苏南京210023 南京市疾病预防控制中心江苏南京210003

竹黄Shiraiabambusicola是一种重要的药用子囊菌,对其分类归属一直存在不同处理意见,主要原因在于形态分类学难以解释其不同的特征表现。为了对竹黄的分类地位做出更接近自然亲缘关系的解释,本研究以自测的*** S4201菌株基因组为基础,结... 详细信息

竹黄Shiraiabambusicola是一种重要的药用子囊菌,对其分类归属一直存在不同处理意见,主要原因在于形态分类学难以解释其不同的特征表现。为了对竹黄的分类地位做出更接近自然亲缘关系的解释,本研究以自测的*** S4201菌株基因组为基础,结合Genome Warehouse(GWH)数据库中公布的*** GZAAS2.1243菌株和Gen Bank数据库中公布的Shiraia ***14菌株的基因组数据,选取nr SSU、nrLSU、tef-1α和rbp24段序列联合分析,与国际真菌生命之树计划(Assembling The Fungal TreeofLife,AFTOL)中的74种子囊菌比较,进行目级归属的系统发育分析;选择ITS、nrLSU和tub23段序列联合分析,与Gen Bank数据库中格孢腔菌目Pleosporales的30种真菌比较,进行科级归属的系统发育分析。分别采用最大似然法(maximum likelihood,ML)和贝叶斯推断法(Bayesian inference,BI)构建系统发育树,结果支持了单独建立竹黄科的分类处理,且竹黄科应归于格孢腔菌目,竹黄属中可能有隐存种。

关键词：竹黄科格孢腔菌目系统发育多基因分类学

多基因联合揭示海南鲌的遗传结构与遗传多样性

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生物多样性 2021年第11期29卷 1505-1512页

作者：向登高李跃飞李新辉陈蔚涛马秀慧贵州大学动物科学学院贵阳550025 中国水产科学研究院珠江水产研究所广州510380

海南鲌(Culter recurviceps)是我国华南地区重要经济鱼类,由于受到近些年水利开发、过度捕捞、环境污染等诸多因素的影响,其资源量快速下降,亟需得到更多的关注和保护。为保护和合理开发海南鲌种质资源,本研究采集了华南地区23个地理群... 详细信息

海南鲌(Culter recurviceps)是我国华南地区重要经济鱼类,由于受到近些年水利开发、过度捕捞、环境污染等诸多因素的影响,其资源量快速下降,亟需得到更多的关注和保护。为保护和合理开发海南鲌种质资源,本研究采集了华南地区23个地理群体207尾海南鲌样本,测定了2个线粒体基因(Cytb和ND2)并从BarcodeofLifeDataSystem数据库获得相对应线粒体COI基因,结合多种分析方法(系统发育分析、分化时间估算、单倍型网状图、群体遗传分析和Mantel检验)对海南鲌的遗传结构和遗传多样性展开研究。系统发育分析和单倍型网状图表明华南地区海南鲌群体被分成3个谱系(I、II和III),其中谱系I和III由珠江的群体组成,谱系II由海南岛的群体组成。分化时间估算发现3个谱系之间的分化时间介于0.028–0.251Ma之间,表明华南地区更新世气候变化可能是造成海南鲌谱系分化的重要原因。群体遗传分析发现海南鲌群体之间存在极显著的遗传分化(FST=0.511,P<0.001),并且符合距离隔离模式(R=0.348,P=0.0010)。群体动态历史分析表明,海南鲌群体可能在0.010–0.025 Ma经历了群体扩张,表明更新世的气候波动也影响了海南鲌的群体大小和分布。综上所述,海南鲌群体由3个谱系组成,更新世气候变化是导致3个谱系分化和影响海南鲌群体动态历史的重要因素。此外,海南鲌群体之间的遗传分化也可能受到了空间距离的影响。

关键词：海南鲌遗传结构遗传多样性多基因

多基因遗传性肿瘤不同阶段转录组学调控规律及其分子机制

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中南大学学报（医学版） 2011年第7期36卷 585-591页

作者：李夏雨沈守荣武明花李小玲熊炜卢建红周鸣马健向娟娟曾朝阳向波周艳宏肖岚周厚德范松青李桂源中南大学疾病基因组研究中心长沙410078 湘雅三医院消化内科长沙410013 肿瘤研究所长沙410078 湘雅二医院代谢内分泌研究所长沙410011 湘雅二医院病理科长沙410011

"多基因遗传性肿瘤不同阶段的转录组学调控规律及其分子机制研究"的国家重大研究计划项目研究团队以肿瘤基因组研究成果为基础,以肿瘤转录组学为主要研究方向,重点对鼻咽癌、乳腺癌、结直肠癌和脑胶质瘤4种多基因遗传性肿瘤的转录组信... 详细信息

"多基因遗传性肿瘤不同阶段的转录组学调控规律及其分子机制研究"的国家重大研究计划项目研究团队以肿瘤基因组研究成果为基础,以肿瘤转录组学为主要研究方向,重点对鼻咽癌、乳腺癌、结直肠癌和脑胶质瘤4种多基因遗传性肿瘤的转录组信息及变化规律、抑瘤/易感基因的筛选鉴定、表观遗传学及miRNA调控的作用机制、转录调控相关的特定基因簇/蛋白质群的转录组和蛋白质组的比较和关联4个方面开展深入的研究。分别发现SPLUNC1,LTF,BRD7,NOR1,BRCA1/2,PALB2,AF1Q,SOX17,NGX6,SOX7和LRRC4等基因在肿瘤始动和侵袭阶段发挥的关键转录调控作用。相继阐明了以miR-141为中心的"SPLUNC1-miR-141-靶基因"的鼻咽癌基因信号调控网络;以人尿激酶型纤溶酶原激活物(uPA)为靶点的"miR-193b-uPA"的乳腺癌基因交互调控通路;以LRRC4为节点的"miR-381-LRRC4-MEK/ERK/AKT"的胶质瘤基因调控通路以及受结肠癌转移相关基因NGX6调控的miRNA及其靶基因群网络。结果表明多基因遗传性肿瘤发生、发展过程中所涉及的关键信号转导通路中的关键分子的变化将导致信号转导通路和基因调控网络的严重障碍,说明多基因肿瘤在发病学上可能是一类"基因信号转导与基因调控网络障碍性疾病"。这些结果和理论为揭示多基因遗传性肿瘤不同阶段发病过程的转录组学规律及其分子机制提供了实验和理论依据。

关键词：多基因肿瘤转录组学表观遗传学 miRNA 转录调控

多基因联合分析棒束孢属Isaria(Ascomycota,Cordycipitaceae)系统发育关系

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菌物学报 2016年第2期35卷 147-160页

作者：代永东虞泓曾文波杨俊媛何璐云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室云南昆明650091

对棒束孢属Isaria及近缘属物种开展5基因(nr SSU、nr LSU、tef-1α、rpb1和rpb2)测序并联合分析,结合Gen Bank相关类群序列,探讨棒束孢属系统发育关系,最终获得95个菌株、58个明确分类群的2–5基因序列。利用MEGA和Mr Bayes软件进行多... 详细信息

对棒束孢属Isaria及近缘属物种开展5基因(nr SSU、nr LSU、tef-1α、rpb1和rpb2)测序并联合分析,结合Gen Bank相关类群序列,探讨棒束孢属系统发育关系,最终获得95个菌株、58个明确分类群的2–5基因序列。利用MEGA和Mr Bayes软件进行多基因聚类分析,结果表明棒束孢属多系起源于虫草菌科中,分3个不同分支。A支主要由Isaria cicadae、***、***、***和***等组成;B支包括***、***、***、***和***;C支仅有***。分支间被Cordyceps militaris、***、***等隔开。棒束孢在形态上,主要以瓶梗基部膨大、尖端变细及孢子呈链状等特征与其他类群分开,但同时也发现有棒状分生孢子梗和单孢子类型。基于节点的分歧时间预测分析,推测棒束孢属首次分化于70Mya,但棒束孢属主要物种形成却在60–55Mya,且3个分支的棒束孢物种为快速同时形成,而后大多数类群表现遗传稳定。同时发现,与Isaria Clade A较近一支有粉被玛利亚霉Mariannaea pruinosa(***无性型)和蛹草蚧霉Lecanicillium militaris(***无性型);与粉棒束孢距离最近一支有Akanthomyces aculeatus(***无性型)和***(***无性型),是两个不同的属征分类群,且相互间遗传距离较近。根据棒束孢属及其近缘种属形态特征的复杂性推测,棒束孢属在快速物种形成中,其近缘类群存在一定程度的丢失和选择性演化。

关键词：棒束孢属多基因多系分歧时间系统发育

多基因双T-DNA植物表达载体的构建及拟南芥转化

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山东大学学报（理学版） 2007年第9期42卷 1-6,29页

作者：李煦王荣春何影杨爱芳山东大学生命科学学院山东济南250100

多基因植物表达载体用于植物遗传转化是培育具有多种优良品质作物的有效策略.双T-DNA系统是实现筛选完成后选择标记基因删除的一种简便可行的方式.为培育高度抗逆或去除标记基因的农作物,构建了多基因双T-DNA植物表达载体2T-bbgdD,其中... 详细信息

多基因植物表达载体用于植物遗传转化是培育具有多种优良品质作物的有效策略.双T-DNA系统是实现筛选完成后选择标记基因删除的一种简便可行的方式.为培育高度抗逆或去除标记基因的农作物,构建了多基因双T-DNA植物表达载体2T-bbgdD,其中含有一个抗除草剂基因bar,3个抗逆相关基因(DREB1A,Na+依赖性Pi转运体基因(d5),betA)和一个报告基因gfp.利用农杆菌介导法将该载体转入拟南芥,获得了多基因共转化及去除标记基因的转基因拟南芥.可将此植物表达载体进一步用于作物的遗传转化.

关键词：植物表达载体 DNA重组多基因双T-DNA 拟南芥遗传转化

登革3型病毒prM-E和NS1多基因重组质粒DNA免疫原性增强效果观察

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中华微生物学和免疫学杂志 2004年第9期24卷 719-723页

作者：段鸿元于曼姜涛邓永强秦成峰陈水平赵慧秦鄂德军事医学科学院微生物流行病研究所一室北京100071

目的　观察登革 3型病毒的prM E和NS1基因重组质粒DNA混合免疫对免疫原性的增强作用 ,为登革DNA疫苗混合免疫提供实验依据。方法　将登革 3型病毒的prM E和NS1基因重组质粒DNA分别混合及单独免疫BALB/c小鼠 ,采用中和试验及MTT法检测免... 详细信息

目的　观察登革 3型病毒的prM E和NS1基因重组质粒DNA混合免疫对免疫原性的增强作用 ,为登革DNA疫苗混合免疫提供实验依据。方法　将登革 3型病毒的prM E和NS1基因重组质粒DNA分别混合及单独免疫BALB/c小鼠 ,采用中和试验及MTT法检测免疫小鼠血清中和抗体及脾细胞特异性CTL(cytotoxicT lymphocytes)杀伤率。结果　混合重组质粒DNA免疫组与单一prM E基因重组质粒DNA免疫组均在末次免疫后第 14天检测到中和抗体 ,在第 33天达到高峰 ,为 1∶32。在末次免疫后第 4 1天 ,当效靶比为 4 0∶1时 ,混合重组质粒DNA免疫组的特异性CTL杀伤率为 15 % ,而 2个单质粒DNA组分别为 10 .9%和 12 .4 %。结论　重组质粒DNA混合免疫可同时诱发小鼠产生体液免疫和细胞免疫 ,而且细胞免疫应答具有一定的增强作用 ,但没有出现特异性CTL杀伤率的协同增强效果。

关键词：重组质粒 DNA免疫特异性CTL 观察免疫后中和抗体多基因质粒DNA BALB/c小鼠病毒

CRISPR/Cas9介导烟草多基因编辑体系的应用

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中国烟草学报 2019年第4期25卷 72-80页

作者：谢小东高军平李泽锋张剑锋魏攀罗朝鹏王晨武明珠翟妞杨军中国烟草总公司郑州烟草研究院国家烟草基因研究中心郑州450001 湖南中烟工业有限责任公司技术研发中心长沙市410008

CRISPR/Cas9是一种新型的基因组定向编辑技术,近年来在烟草基因组的定向编辑中得到了广泛应用。CRISPR/Cas9介导的多基因编辑技术在许多物种中表现出很大的潜力,为了探索CRISPR/Cas9介导烟草多基因编辑的技术体系,本文针对烟草PCS1、HMA... 详细信息

CRISPR/Cas9是一种新型的基因组定向编辑技术,近年来在烟草基因组的定向编辑中得到了广泛应用。CRISPR/Cas9介导的多基因编辑技术在许多物种中表现出很大的潜力,为了探索CRISPR/Cas9介导烟草多基因编辑的技术体系,本文针对烟草PCS1、HMA2、eIF4E、TOM3、TOM1 5个不同性状相关的基因构建了多靶点敲除的CRISPR/Cas9系统,并借助农杆菌介导的遗传转化技术转化烟草品种K326。对阳性植株的筛选、靶位点基因组的PCR扩增与测序分析表明,构建的CRISPR/Cas9多基因编辑系统成功转化到烟草中,能够同时靶向突变5个基因。5个基因同时突变的检出率为53.8%,单基因的突变检出率在76.9%与92.3%之间。进一步的脱靶检测分析显示,在所预测脱靶的候选位点上均未发生脱靶现象。本文构建的CRISPR/Cas9多基因编辑系统可将多个基因进行有效突变,为烟草基因功能研究和基于CRISPR/Cas9技术的多性状改良奠定了基础。

关键词：烟草 CRISPR/Cas9 多基因突变

多基因序列鉴定油茶炭疽病原Colletotrichum boninense新种

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热带作物学报 2015年第5期36卷 972-977页

作者：汤铱泠周国英李河钟文斌龚洪恩王丽云中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室湖南长沙410004 中国林业科学研究院亚热带林业实验中心江西分宜336600

油茶炭疽病是中国油茶最重要的病害之一,为进一步对油茶炭疽病原进行研究,通过柯赫氏法验证,从海南澄迈和江西分宜的油茶叶上分离到有别于其它炭疽病菌的致病菌3株。菌株在PDA培养基上,菌落圆形,呈奶油色至橙黄色,菌丝生长速度为10.8-11... 详细信息

油茶炭疽病是中国油茶最重要的病害之一,为进一步对油茶炭疽病原进行研究,通过柯赫氏法验证,从海南澄迈和江西分宜的油茶叶上分离到有别于其它炭疽病菌的致病菌3株。菌株在PDA培养基上,菌落圆形,呈奶油色至橙黄色,菌丝生长速度为10.8-11.3 mm/d;附着胞为椭圆形,呈深褐色至棕黑色,边缘整齐,大小为（5.3±0.9）μm×（16.1±1.1）μm;分生孢子初为橘黄色,后形成黑色孢子团,大小为（14.5±2.5）μm×（5.6±1.6）μm。多基因系统发育树显示3株病原菌与博宁炭疽菌（Colletotrichum boninense）的模式株MAFF 305972聚为一个进化枝,且达到100%的置信度。结合其形态和多基因分析,结果表明：3个菌株为博宁炭疽菌（***）,是能侵染油茶树的炭疽菌种。

关键词：油茶炭疽病多基因博宁炭疽菌